Data Manager pour la gestion des données multimodales du projet Milieu Intérieur H/F

Institut Pasteur; Paris; Sur place; EUR 45 000 - 60 000; Plein temps

Résumé du poste

L'Institut Pasteur recherche un Data Manager pour gérer des données multimodales du projet Milieu Intérieur. Le candidat sera responsable du cycle de vie des données biologiques et du développement d'outils facilitant leur accessibilité. Ce rôle nécessite des compétences en programmation, une expérience significative, et une passion pour l'analyse de données dans un environnement scientifique.

Prestations

Politique de congés et RTT favorable

Possibilité de télétravail

Remboursement de 75% des titres de transport

Cantine d'entreprise

Mutuelle familiale gratuite

Salles de sports sur campus

Engagements RSE

Environnement multiculturel sur le campus

Qualifications

• Minimum 3 ans d'expérience en gestion de données.
• Maîtrise des langages R, Python, et SQL.
• Connaissances en génétique ou biologie appréciées.

Responsabilités

• Gérer le cycle de vie de grands ensembles de données biologiques.
• Développer des outils pour l'accès et l'exploration des données.
• Préparer des jeux de données pour le partage avec des laboratoires.

Connaissances

Gestion de données

Programmation en R

Programmation en Python

SQL

Unix shell

Formation

Master en bio-informatique

Description du poste

Identifiant (email, de type [e-mail])

Mots clés (ex : Ingénieur Bio informaticien)

Data Manager pour la gestion des données multimodales du projet Milieu Intérieur H/F

Description du poste

Métier

Informatique - Ingénieur technique confirmé (Informatique)

Intitulé du poste

Data Manager pour la gestion des données multimodales du projet Milieu Intérieur H/F

Missions/Activités

L'Institut Pasteur conduit des recherches biomédicales de pointe et avant-gardistes depuis plus de 130 ans.
Sur notre campus de 5 hectares en plein Paris (15è arrondissement), dans un environnement multiculturel et stimulant, 3000 personnes collaborent pour répondre aux ambitions de l'Institut Pasteur.

Le projet Milieu Intérieur (http://www.milieuinterieur.fr/fr) est une étude de cohorte ambitieuse visant à analyser l'impact de la génétique et de l'environnement, ainsi que leurs interactions, sur le système immunitaire humain. Ses objectifs sont d'établir une compréhension approfondie de la variation immunitaire dans la population générale, et de déterminer le rôle de la génétique, du vieillissement, de la consommation de tabac, ou du microbiote dans la régulation des programmes immunitaires. La ou le data manager traitera et gérera le cycle de vie de grands ensembles de données biologiques (génomes humains, transcriptomes, epigénomes, microbiomes, etc.) et développera des outils facilitant l'accès aux données pour le projet. Il, elle sera rattaché·e à la Plateforme de Data Management de l'Institut Pasteur qui regroupe 9 data managers et 2 data stewards.

Plus précisément, la ou le candidat.e sera en charge de :
- la gestion de multiples données “omics” générées par le Consortium Milieu Intérieur, en collaboration avec les coordonnateurs et bioinformaticien·ne·s du Consortium
- le développement d'outils en ligne permettant d'explorer les résultats résumés du Milieu Intérieur, afin de promouvoir la science ouverte
- la préparation des jeux de données documentés en vue de leur partage avec des laboratoires extérieurs, afin de promouvoir la reproductibilité de la science
- le dépôt de l'ensemble des données “omics” sur Owey, le datalake de l'Institut Pasteur

Nous recherchons un.e candidat·e qui aime coder, structurer, organiser des gros volumes de données type Big Data. Des connaissances en génétique ou en biologie seraient un plus.

- Diplôme : niveau Master en bio-informatique
- Expérience : minimum 3 ans d'expérience
- Maîtrise de l'anglais, niveau B2.
- Maîtrise des langages de programmation (R, Python, SQL, Unix shell…), une expérience en HPC (Calcul à Haute Performance) serait appréciée
- Maitrise des bonnes pratiques de gestion de grands ensembles de données
- Compétence dans le traitement de grands ensembles de données
- Grande capacité à travailler en équipe et à centraliser l'information (milieu très collaboratif)
- Bonne communication avec les membres de l'équipe

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Vos conditions et environnement de travail :

- Politique de congés et RTT très favorable (Forfait 204 jours)
- Possibilité de télétravail
- Forfait mobilité douce ou remboursement de 75% des titres de transport
- Cantine d'entreprise, restaurant, cafétérias
- Mutuelle familiale (gratuité conjoints/enfants) et service de santé pour les collaborateurs sur le campus
- Salles de sports, 30 activités culturelles/artistiques/sportives sur le campus
- Engagements RSE forts, et initiatives des collaborateurs encouragées
- Environnement multiculturel (plus de 75 nationalités sur le campus)

#PasteurRecrute1