Responsable Bio-Informatique F / H (CDI)

HADLEY SEARCH; Paris; Sur place; EUR 50 000 - 70 000; Plein temps

Résumé du poste

Une entreprise de recrutement spécialisée recherche un Responsable de Service Bio-Informatique pour intégrer le Collecteur Analyseur de Données. Vous dirigerez une équipe de bio-informaticiens et serez en charge de configurer et optimiser les pipelines bio-informatiques. Le candidat idéal doit avoir plus de 5 ans d'expérience et une formation spécialisée. Un esprit d'analyse et une capacité à innover sont requis. Le poste est basé à Paris, en Nouvelle-Aquitaine.

Qualifications

• Plus de 5 ans d’expérience dans l'ingénierie de logiciels bio-informatiques.
• Expert en manipulation de données 'omiques'.
• Maîtrise du cadre réglementaire des données de santé.

Responsabilités

• Manager une équipe de bio-informaticiens.
• Assurer la pertinence des choix logiciels et algorithmiques.
• Configurer et optimiser les pipelines bio-informatiques.
• Apporter expertise aux porteurs de projets scientifiques.
• Contribuer au développement de méthodes bio-informatiques.

Connaissances

Gestion de données 'omiques'

Expertise en bio-informatique

Moteurs de workflow (Snakemake, Netflow)

Analyse des données

Capacité à fédérer une équipe

Innovation

Formation

Formation supérieure spécialisée en bio-informatique

Outils

Snakemake

Netflow

Description du poste

Hadley Search, cabinet de recrutement dédié aux acteurs du secteur public et aux collectivités, recrute pour le Collecteur Analyseur de Données (CAD), un Responsable de Service Bio-Informatique F / H.

Le CAD est un Groupement d'Intérêt Public développé dans le cadre du Plan France Médecine Génomique 2025 (PFMG). Créé le30 novembre 2022, le GIP-CAD regroupe les représentants de l'État (MSP et MESR), les Laboratoires de Médecine Génomique SeqOIA et AUTRAGEN, Unicancer, la Conférence des Directeurs Généraux de CHU, le CEA, l'Inria, l'Inserm et France Universités.

Le GIP-CAD a pour but de proposer des services liés à l'activité de soin du PFMG : aide à l'interprétation médicale des examens pangénomiques effectués par les Laboratoires de Médecine Génomique du PFMG, aide à la réanalyse des données et archivage des données de séquençage. Il a également pour objectif de permettre la réutilisation des données de génomique pour la recherche.

Le Plan France Médecine Génomique 2025, initié en 2016, développe les conditions nécessaires à l'accès à tous au diagnostic génétique en France. Il vise 3 objectifs : intégrer la médecine génomique dans le parcours de soins courant et la prise en charge des pathologies, développer une filière nationale de médecine génomique au service des patients capable d'être un levier d'innovation scientifique et technologique et placer la France dans le peloton de tête des grands pays engagés dans la médecine personnalisée.

Au sein de la Direction des Services Opérationnels et Innovants, le service bio-informatique a pour principales missions de traiter les données de génomique, participer à la mise à disposition d'outils bio-informatiques et apporter son expertise bio-informatique à l'ensemble des collaborateurs du CAD et aux porteurs de projets externes, nationaux ou internationaux. Les données concernées sont les données de génomique mises à disposition auprès du CAD (BAM / CRAM VCF, données contextuelles) issues de séquençages (principalement WES et WGS). Le traitement intervient sur l'ensemble du cycle de vie de la donnée, depuis l'évaluation de la qualité des données réceptionnées jusqu'à la réalisation de projets en lien avec celles-ci.

En tant que Responsable de Service Bio-Informatique, vos missions principales sont :

• Manager le service bio-informatique composé de 3 bio-informaticiens
• S'assurer du bon usage (pertinence des choix logiciels et algorithmiques) et des paramétrages logiciels pour une bonne exécution des logiciels bio-informatiques
• Configurer et optimiser les " pipelines bio-informatiques " pour exploiter au mieux l'infrastructure proposée par le CAD
• Apporter expertise et conseil aux porteurs de projets scientifiques
• Proposer des approches et méthodologies bio-informatiques pour répondre aux problématiques scientifiques des projets
• Contribuer au développement de nouvelles approches bio-informatiques (design, prototypage et documentation)
• Assurer la gestion du catalogue de logiciels bio-informatiques
• Participer à l'identification et à l'évaluation des solutions d'analyse des données génomiques et cliniques répondant aux besoins du CAD, tant en support des projets internes qu'externes

Issu d'une formation supérieure spécialisée en bio-informatique, vous évoluez depuis plus de 5 ans dans l'ingénierie de logiciels bio-informatiques. Vous êtes un expert de la manipulation de données " omiques " et des approches bio-informatiques. Vous maîtrisez les moteurs de workflow tels que Snakemake ou Netflow et le cadre réglementaire appliqué à l'utilisation de données de santé et au développement de logiciels de santé.

Reconnu pour votre esprit d'analyse et votre sens de l'innovation, vous conjuguez expertise métier et capacité à fédérer une équipe. Vous accompagnez vos collaborateurs avec bienveillance et exigence dans une logique de recherche de performance et d'innovation. Vous démontrez de réelles aptitudes à la prise de décision et au développement d'une logique partenariale avec des acteurs variés de l'écosystème de la Santé.