Data Manager pour la Gestion des Données Multimodales du Projet Milieu Intérieur H / F

INSTITUT PASTEUR; Levallois-Perret; Hybride; EUR 40 000 - 55 000; Plein temps

Résumé du poste

Une institution de recherche en santé à Levallois-Perret recherche un(e) data manager pour gérer le cycle de vie de données omiques et développer des outils en ligne pour l'accès aux données. Le candidat idéal a un Master en bio-informatique, au moins 3 ans d'expérience, et maîtrise les langages R, Python et SQL. L'environnement de travail est multiculturel et propose des conditions favorables incluant télétravail et politiques de congés avantageuses.

Prestations

Politique de congés et RTT favorable

Télétravail possible

Remboursement de 75% des titres de transport

Cantine d'entreprise

Mutuelle familiale

Salles de sport

Activités culturelles et sportives

Qualifications

• Minimum 3 ans d'expérience en bio-informatique.
• Maîtrise des langages R, Python, SQL et Unix shell.
• Bonne capacité à travailler en équipe.

Responsabilités

• Gestion des données omics générées par le Consortium Milieu Intérieur.
• Développement d'outils en ligne pour l'exploration des résultats.
• Préparation de jeux de données pour leur partage avec des laboratoires.

Connaissances

Bio-informatique

R

Python

SQL

Unix shell

HPC (Calcul à Haute Performance)

Gestion de grands ensembles de données

Travail en équipe

Anglais (B2)

Formation

Master en bio-informatique

Description du poste

Overview

Le projet Milieu Intérieur (http://www.milieuinterieur.fr/fr) est une étude de cohorte visant à analyser l'impact de la génétique et de l'environnement, et leurs interactions, sur le système immunitaire humain. Ses objectifs sont d'établir une compréhension approfondie de la variation immunitaire dans la population générale et de déterminer le rôle de la génétique, du vieillissement, de la consommation de tabac ou du microbiote dans la régulation des programmes immunitaires. Le/La data manager traitera et gérera le cycle de vie de grands ensembles de données biologiques (génomes humains, transcriptomes, épigénomique, microbiomes, etc.) et développera des outils facilitant l'accès aux données pour le projet. Il/Elle sera rattaché(e) à la Plateforme de Data Management de l'Institut Pasteur, qui regroupe 9 data managers et 2 data stewards.

Responsibilities

• Gestion de multiples données omics générées par le Consortium Milieu Intérieur, en collaboration avec les coordonnateurs et le bioinformaticien du Consortium.
• Développement d'outils en ligne permettant d'explorer les résultats résumés du Milieu Intérieur, afin de promouvoir la science ouverte.
• Préparation des jeux de données documentés en vue de leur partage avec des laboratoires extérieurs, afin de promouvoir la reproductibilité de la science.
• Dépôt de l'ensemble des données omics sur Owey, le datalake de l'Institut Pasteur.

Profile / Qualifications

• Diplôme : niveau Master en bio-informatique.
• Expérience : minimum 3 ans d'expérience.
• Maîtrise de l'anglais, niveau B2.
• Maîtrise des langages de programmation (R, Python, SQL, Unix shell); expérience en HPC (Calcul à Haute Performance) appréciée.
• Maîtrise des bonnes pratiques de gestion de grands ensembles de données et compétence dans le traitement de grands ensembles de données.
• Grande capacité à travailler en équipe et à centraliser l'information dans un milieu très collaboratif.
• Bonne communication avec les membres de l'équipe.

Conditions et environnement de travail

• Politique de congés et RTT très favorable (Forfait 204 jours).
• Possibilité de télétravail.
• Forfait mobilité douce ou remboursement de 75% des titres de transport.
• Cantine d'entreprise et services de restauration.
• Mutuelle familiale et service de santé pour les collaborateurs sur le campus.
• Salles de sport et nombreuses activités culturelles, artistiques et sportives sur le campus.
• Engagements RSE et initiatives des collaborateurs encouragées.
• Environnement multiculturel (plus de 75 nationalités sur le campus).