Ingénieur-e en expérimentation et instrumentation biologiques H/F

CNRS; Toulouse; Sur place; EUR 35 000 - 50 000; Plein temps

Résumé du poste

Un institut de recherche en sciences biologiques à Toulouse recherche un(e) ingénieur(e) en expérimentation et instrumentation biologiques. Le candidat idéal doit avoir une solide expérience en protéomique et en spectrométrie de masse, ainsi qu'en analyse bioinformatique. Ce poste exige une maîtrise des méthodes de MS pour gérer des projets collaboratifs en biologie et santé. Des connaissances en réglementation d'hygiène et sécurité ainsi que la capacité d'encadrer des utilisateurs sont également requises. Ce poste offre une occasion unique de contribuer à des recherches de pointe dans un environnement dynamique.

Qualifications

• Connaissance approfondie en spectrométrie de masse.
• Expérience en analyse bioinformatique.
• Maîtrise des techniques de séparation des protéines.

Responsabilités

• Conduire des projets de recherche en protéomique.
• Développer des stratégies d'analyses protéomiques.
• Rédiger des rapports d'analyse et des protocoles.

Connaissances

Acquisition et traitement des données protéomiques

Masters en biochimie ou biologie

Langue anglaise : B2 à C1

Formation

Ingénieur ou équivalent

Outils

Excalibur

MaxQuant

ProteomeDiscoverer

Description du poste

Ingénieur-e en expérimentation et instrumentation biologiques H/F

Date Limite Candidature : jeudi 15 janvier 2026 17:00:00 heure de Paris

Informations générales

Réservé aux agents CNRS (fonctionnaires et CDI) et aux fonctionnaires et CDI de droit public
Intitulé de l'offre : Ingénieur-e en expérimentation et instrumentation biologiques H/F
Référence : UMR5089-MOBINT-P53014
Lieu de travail : TOULOUSE
Institut : INSB - Institut des sciences biologiques
Date de publication : mercredi 3 décembre 2025
Session : Campagne Hiver 2026
Groupe de Fonction : IEG3
BAP : A - Sciences du vivant, de la terre et de l'environnement
Emploi type : Ingenieure ou ingenieur en experimentation et instrumentation biologiques

Missions

Sous la direction des responsables de l'équipe protéomique et de la plateforme protéomique à l'IPBS, l'ingénieur-e conduira et développera des stratégies d'analyses protéomiques à large échelle afin de gérer en autonomie des projets collaboratifs de recherche en biologie et santé et de répondre aux enjeux récents du domaine, comme la protéomique de la cellule unique.

Il/elle mettra également en œuvre et adaptera différentes méthodes de spectrométrie de masse (MS) structurale pour l'analyse de protéines telles que la protéomique top-down, la MS native l'échange hydrogène-deutérium couplé à la spectrométrie de masse et la photométrie de masse.

Activités

Activités principales

• Assurer la mise en œuvre des différentes méthodes de MS implémentées sur la plateforme (Bottom-Up MS, Top-Down MS, MS native, HDX-MS et photométrie de masse) et le traitement bioinformatique des données MS (recherche en banques de données, analyse quantitative des données et analyse structurale à l'aide de logiciel dédiés).
• Rechercher et définir, en fonction de chaque système protéique étudié, la ou les méthode(s) d'analyse adaptée(s).
• Définir et mettre au point les protocoles expérimentaux et processus de traitement des échantillons (enrichissement, dessalage, digestion...).
• Interpréter et présenter les résultats d'analyse.
• Rédiger les rapports d'analyse, les notes techniques et les protocoles de mise en œuvre des méthodes d'utilisation des spectromètres de masse.
• Contrôler, calibrer, nettoyer régulièrement les spectromètres de masse et gérer les opérations de maintenance.
• Appliquer la démarche qualité de la plateforme, piloter et participer à l'amélioration continue des processus qualité.
• Assurer la formation et l'encadrement des utilisateurs (étudiants, personnel non permanents...).

Activités associées

• Diffuser et valoriser les résultats et réalisations technologiques (rapports, brevets, publications, présentations orales).
• Assurer et organiser la veille scientifique et technologique dans son domaine d'activité.
• Animer des réseaux professionnels d'échange de compétences.
• Appliquer et faire appliquer les règles en hygiène et sécurité et leur évolution.
• Assurer des actions de formation (cours, TP, écoles thématiques et ateliers sur la MS).
• Gérer des commandes.

Compétences

Connaissances/savoirs fondamentaux

• Acquisition et traitement des données protéomiques par spectrométrie de masse (connaissance approfondie).
• Informatique appliquée (connaissance approfondie).
• Spectrométrie de Masse Structurale (connaissance approfondie des différentes méthodes).
• Biologie / Chimie / Biochimie des protéines (connaissance approfondie).
• Biologie Structurale.
• Outils mathématiques et informatiques nécessaires à l'exploitation des résultats de MS structurale.
• Concepts de qualité appliqués aux techniques de spectrométrie de masse.
• Techniques séparatives et de préparation d'échantillons protéiques et peptidiques (purification, dessalage, digestion...).
• Réglementation en matière d'hygiène et de sécurité et risques professionnels (chimiques, électriques, microbiologiques...).
• Langue anglaise : B2 à C1 (cadre européen commun de référence pour les langues).

Compétences opérationnelles

• Maîtriser les méthodes biochimiques et les techniques séparatives des protéines et des peptides (lyse cellulaire, dosage, fractionnement HPLC, purification par affinité, dessalage, digestion enzymatique,...).
• Maîtriser les méthodes d'acquisition et les outils informatiques de pilotage des spectromètres de masse pour l'analyse des peptides et protéines (Excalibur, Data Analysis, MassLynX).
• Maîtriser les logiciels de traitements des données MS en protéomique quantitative et MS structurale (MaxQuant, ProteomeDiscoverer, DIANN, Spectronaut,..) et les méthodes d'analyses statistiques.
• Appliquer les techniques de maintenance des appareils et garantir la qualité des données acquises.
• Mettre en œuvre la démarche qualité (ISO9001, NFX 50-900).
• Appliquer les règles d'hygiène et de sécurité.
• Maîtriser l'utilisation des outils de recherche bibliographique.
• Transmettre des connaissances.
• Interagir avec l'ensemble des interlocuteurs (collaborateurs, équipe, SAV).

Contexte de travail

L'IPBS regroupe des équipes de biologistes dans les domaines du cancer et des maladies infectieuses, qui utilisent la protéomique et la spectrométrie de masse (MS) structurale pour caractériser et valider de nouvelles voies et cibles thérapeutiques. La personne recrutée intégrera l'équipe Protéomique et Spectrométrie de Masse des Biomolécules (22 membres), qui héberge la plateforme protéomique de Toulouse (proteotoul.ipbs.fr, label IBiSA, normes ISO9001/NFX 50-900, intégrée au réseau local des plateformes Génotoul), et constitue un des trois nœuds fondateurs (huit nœuds aujourd'hui) de l'Infrastructure Nationale de protéomique, ProFI. L'équipe mène des recherches en protéomique à large échelle et en MS structurale et répond aux besoins de la communauté scientifique en biologie, santé et agrobiosciences.

L'ingénieur.e recruté.e jouera un rôle clé dans l'organisation de l'équipe et contribuera activement aux actions menées par ProFI. Il/Elle appliquera toutes les étapes des approches de protéomique à large échelle et/ou de MS structurale, de la préparation des échantillons à l'analyse bioinformatique des données. Il/Elle mettra en œuvre et optimisera les techniques nano- et micro-chromatographiques pour la séparation de peptides et protéines, ainsi que les méthodes d'acquisition MS sur les divers instruments du parc (Orbitrap Q-Exactive, Fusion, Exploris et Q-TOF TimsTOF, SynaptG2Si). Il/Elle participera aux développements récents de la protéomique en cellule unique, de l'immunopeptidomique et des méthodes de MS structurale (top-down MS, MS native, HDX-MS). Il/Elle travaillera en collaboration avec les biologistes/structuralistes pour exploiter les données et répondre aux problématiques biologiques.