Vers une compréhension fine de la régulation de l'expression des gènes par l'acétylation et la [...]

CEA; Grenoble; Sur place; EUR 20 000 - 40 000; Plein temps

Résumé du poste

Un institut de recherche est à la recherche d'un doctorant pour étudier la régulation de l'expression des gènes par des modifications d'histones. Le candidat idéal aura une formation en bioinformatique ou en mathématiques appliquées et contribuera à la recherche visant à comprendre les mécanismes de régulation qui sous-tendent de nombreuses maladies. La thèse est localisée à Grenoble et le poste est disponible à partir d'octobre 2025.

Qualifications

• Formation recommandée en bioinformatique ou en mathématiques appliquées.

Responsabilités

• Contribuer au déchiffrage du 'code histone'.
• Étudier le rôle des lactylations sur le programme transcriptionnel.
• Intégrer de nouvelles données dans des modèles de réseaux de neurones.

Connaissances

Bioinformatique

Mathématiques appliquées

Description du poste

Description du sujet de thèse

Entreprise non spécifiée dans le texte.

Domaine

Sciences du vivant

Sujets de thèse

Vers une compréhension fine de la régulation de l'expression des gènes par l'acétylation et la lactylation des protéines histones

Contrat

Thèse

Description de l'offre

Dans les cellules eucaryotes, l'ADN s'enroule autour de protéines histones pour former la chromatine. La modification dynamique des histones par diverses structures chimiques permet de réguler finement l expression des gènes. Des altérations dans ces mécanismes complexes de régulation sont à l'origine de nombreuses maladies. L'acétylation des lysines d'histones est connue pour induire l'expression des gènes. D'autres structures peuvent être ajoutées sur les histones, dont les effets sur la transcription restent largement à élucider. La plupart d'entre elles, comme la lactylation découverte en 2019, dépendent du métabolisme cellulaire. Nous avons commencé l'étude de la lactylation dans la spermatogenèse murine. Ce processus de différentiation cellulaire constitue en effet un modèle de choix pour étudier la régulation de la transcription, du fait de changements spectaculaires dans la composition de la chromatine et dans le programme d'expression génique. Nous avons généré de nouveaux profils épigénétiques consistant en la distribution sur le génome de marques acétylées et lactylées sur trois lysines de l'histone H3. L'objet de cette thèse est de contribuer au déchiffrage du "code histone", d'abord en étudiant le rôle des lactylations sur le programme transcriptionnel. Ensuite, la prédiction d'états chromatiniens sera raffinée en intégrant au sein de modèles de réseaux de neurones nos nouvelles données à l'ensemble des données épigénomiques existant aux deux stades cellulaires étudiés.

Université / école doctorale

Chimie et Sciences du Vivant (EDCSV) Université Grenoble Alpes

Localisation du sujet de thèse

Site: Grenoble

Critères candidat

Formation recommandée: bioinformatique, mathématiques appliquées

Demandeur

Disponibilité du poste: 01/10/2025

Personne à contacter par le candidat

PFLIEGER Delphine [e-mail]
CNRS
UA13 Inserm/CEA/Université Grenoble Alpes
EDYP/BGE/DS/IRIG
CEA de Grenoble
17 rue des Martyrs
38054 GRENOBLE cedex 09
0438782265

Tuteur / Responsable de thèse

PFLIEGER Delphine [e-mail]
CNRS
UA13 Inserm/CEA/Université Grenoble Alpes
EDYP/BGE/DS/IRIG
CEA de Grenoble
17 rue des Martyrs
38054 GRENOBLE cedex 09
0438782265

En savoir plus

https://www.edyp.fr/web/2019/10/22/integrative-omics/

https://www.bge-lab.fr/Pages/Presentation.aspx