STAGE en écologie des mycorhizes H/F

EDYSAN UMR7058 CNRS-UPJV; Hauts-de-France; Sur place; Plein temps

Résumé du poste

Un laboratoire universitaire en écologie recherche un(e) stagiaire en Master 2 pour participer à une étude sur les interactions entre plantes et champignons mycorhiziens. Le stage, d'une durée de 6 mois, débutera en janvier 2026. Les responsabilités incluent la culture de champignons, la préparation d'inocula pour des essais sur le peuplier, et l'analyse de données écologiques. Un excellent dossier académique et un intérêt pour l'écologie des symbioses sont requis.

Qualifications

• Étudiant(e) en Master 2 avec un excellent dossier.
• Intérêt pour l'écologie des symbioses plante–champignon et biologie évolutive.
• Connaissances en culture microbienne et analyses de données seront appréciées.

Responsabilités

• Participation à l'étude des relations entre traits fonctionnels et génomiques.
• Culture in vitro de souches fongiques sélectionnées.
• Préparation d'inocula pour essais sur le peuplier.
• Contribuer à des expériences écologiques.
• Compiler et analyser des données avec RStudio.

Connaissances

Rigueur expérimentale

Autonomie

Capacité de synthèse

Travail en équipe

Culture microbienne

Analyses de données sous RStudio

Formation

Master 2 en écologie, biologie, microbiologie, sylviculture, agronomie

Description du poste

Contexte du recrutement et définition de poste :

Les champignons mycorhiziens jouent un rôle essentiel dans les stratégies adaptatives des plantes, en améliorant l'acquisition des nutriments et la tolérance aux conditions limitantes. Ces symbioses, qui habitent les sols de la quasi-totalité des écosystèmes terrestres, ont évolué à plusieurs reprises au sein de lignées fongiques présentant une grande diversité de traits fonctionnels et de répertoires génomiques. Comprendre comment ces caractéristiques fongiques sont liées à l'adaptation des plantes est essentiel pour anticiper la réponse des communautés forestières face au changement climatique.

Missions :

• La stagiaire participera à l'étude des relations entre les traits fonctionnels et les caractéristiques génomiques de champignons mycorhiziens appartenant à différentes guildes symbiotiques : ectomycorhiziennes, éricoïdes et arbusculaires. Ses missions comprendront :
• La culture in vitro de souches fongiques sélectionnées,
• La préparation d'inocula standardisés pour des essais sur le peuplier (Populus nigra),
• La contribution à la mise en place d'expériences écologiques sur plateformes de phénotypage numérique,
• Et la compilation et l'analyse de données de traits écologiques et génomiques à l'aide de RStudio.

Ce stage s'inscrit dans le cadre d'un projet de recherche portant sur les interactions entre plantes et champignons mycorhiziens, et sur la manière dont ces communautés forestières s'adaptent au changement climatique.

Durée

6 mois

Début

Janvier 2026

Encadrant

Marco Cosme, professeur junior

Dossier de candidature

Les candidats sont invités à envoyer un CV, une lettre de motivation, le relevé de notes du Master, et, si possible, une lettre de recommandation de l'encadrant du stage de Master 1 ou d'autres encadrants précédents.

Profil recherché

Étudiant(e) en Master 2 avec un excellent dossier, en écologie, biologie des organismes, microbiologie, sylviculture, agronomie ou disciplines proches.

Un intérêt marqué pour l'écologie des symbioses plante–champignon, la biologie évolutive et l'écologie fonctionnelle est attendu.

Des connaissances de base en culture microbienne et/ou en analyses de données sous RStudio seront appréciées.

Qualités attendues

Le candidat devra faire preuve de rigueur expérimentale, d'autonomie au laboratoire, d'une bonne capacité de synthèse et d'un esprit de travail en équipe.