Bio-informaticien-ne H/F

CNRS; Poitiers; Sur place; EUR 35 000 - 45 000; Plein temps

Résumé du poste

Une institution de recherche à Poitiers recherche un(e) Bio-informaticien-ne pour développer des outils mathématiques et informatiques afin d'étudier et modéliser des phénomènes biologiques. Le candidat idéal maîtrisera les langages R, MATLAB et Python, et sera capable de travailler sur des projets de recherche nationaux et internationaux. Ce poste offre un environnement dynamique et innovant avec de nombreuses possibilités de formation.

Prestations

Indemnité de Référence pour les Informaticiens (IRI)

Formation continue

Environnement de travail stimulant

Qualifications

• Excellente maîtrise des langages de programmation R, MATLAB et Python.
• Solides compétences en mathématiques appliquées et algorithmique.
• Expérience en modélisation et simulation numérique demandée.

Responsabilités

• Développer et maintenir des outils mathématiques et informatiques.
• Piloter des projets techniques en lien avec les méthodes de calcul.
• Participer aux projets de recherche et publications associées.

Connaissances

Langages de programmation: R, MATLAB, Python

Mathématiques appliquées

Algorithmique

Outils de calcul scientifique

Modélisation et simulation numérique

Connaissance des architectures techniques

Méthodologie de conduite de projet

Formation

Diplôme en bioinformatique ou domaine similaire

Description du poste

Date Limite Candidature : jeudi 15 janvier 2026 17:00:00 heure de Paris

Informations générales

Réservé uniquement aux agents CNRS (fonctionnaires et CDI)

Intitulé de l'offre : Bio-informaticien-ne H/F

Référence : UMR7262-MOBINT-K55010

Lieu de travail : POITIERS

Institut : INEE - Institut d'écologie et environnement

Date de publication : mercredi 3 décembre 2025

Session : Campagne Hiver 2026

Groupe de Fonction : IRG3

BAP : E - Informatique, Statistiques et Calcul scientifique

Emploi type : Experte ou expert en calcul scientifique

Missions

Mobiliser et développer des outils mathématiques et informatiques pour résoudre des problématiques relatives à l'étude, la simulation et à la modélisation de phénomènes biologiques et évolutionnaires.

Activités

• Piloter des projets techniques qui concourent par des méthodes de calcul à la résolution d'une problématique scientifique dans ses dimensions techniques, humaines et administratives ;
• Apporter auprès des chercheurs d'un domaine une expertise dans l'utilisation des méthodes mathématiques et des techniques informatiques pour la modélisation et la simulation d'un phénomène biologique et évolutionnaire ;
• Développer des outils et des modèles analytiques et orienter les choix sur les méthodes pertinentes ;
• Concevoir des méthodes pour la modélisation, le calcul et la visualisation des résultats ;
• Développer et maintenir des codes et des solutions logicielles issues du dialogue chercheur-ingénieur ;
• Evaluer la qualité des solutions proposées ainsi que la qualité des résultats et de leur interprétation ;
• Participer à des projets de recherche du laboratoire PALEVOPRIM au plan national et international et aux publications associées ;
• Assurer la gestion du cycle de vie des données du calcul, leur organisation et le suivi de leur exploitation jusqu'à leur valorisation ;
• Transmettre les connaissances et les compétences en matière de calcul scientifique, au travers de présentation et de formation ;
• Participer au choix et à l'exploitation des calculateurs de haute performance ;
• Définir une veille technologique sur l'évolution des architectures matérielles et des systèmes concernés ;
• S'inscrire dans les principes FAIR pour une science ouverte.

Compétences

Savoir :

• Compétences en langages de programmation : R, MATLAB, Python ;
• Compétences en mathématiques appliquées ;
• Compétences en algorithmique ;
• Compétences en outils de calcul scientifique ;
• Compétences en modélisation et simulation numérique ;
• Connaissance des architectures techniques, outils et progiciels ;
• Compétences en méthodologie de conduite de projet.

Savoir-faire :

• Piloter un projet en concertation avec les chercheurs du laboratoire ;
• Apporter des réponses à des besoins spécifiques ;
• Mettre au point ou adapter des techniques nouvelles ;
• Programmer dans différents environnements informatiques ;
• Mettre en œuvre une démarche qualité ;
• Rédiger des documents ;
• Accompagner et conseiller ;
• Assurer une veille technologique et scientifique ;
• Intégrer la communauté sur des réseaux nationaux ;
• Former et échanger avec les membres du laboratoire, y compris ceux peu familiers avec les outils ;
• Interagir dans un écosystème interdisciplinaire ;
• Travailler en équipe ;
• Langue anglaise : niveau B2 à C1 (cadre européen commun de référence pour les langues).

Savoir-être :

• Communiquer efficacement et faire preuve de pédagogie ;
• Collaborer au sein d'une équipe pluridisciplinaire ;
• Être à l'écoute et adaptable ;
• Être orienté.e solutions ;
• Faire preuve de rigueur et de curiosité scientifique.

Contexte de travail

PALEVOPRIM développe des outils analytiques pour traiter les données paléontologiques et biologiques. L'utilisation de données numériques et virtuelles a augmenté de manière exponentielle. Si les membres de l'unité sont familiers avec ce type de données et le potentiel qu'elles renferment, la mise en place d'outils analytiques et de logiciels efficients, libres d'accès et gratuits via des langages de programmations nécessite de nouvelles compétences.

La pluralité de nos questionnements et approches s'exprime notamment dans la compréhension (1) des changements morphologiques sur la base d'études utilisant le difféomorphisme ou IA, (2) des relations entre forme et fonction dans des systèmes locomoteurs ou masticatoires via des approches issues de la physique biomécanique ou des outils d'analyses topographiques, (3) de l'analyse, au sein des communautés, des réseaux trophiques et des relations organismes-environnement.

Nos recherches portent sur des référentiels actuels et fossiles issus de fouilles en France et à l'étranger (jusqu'à 60 Ma), souvent basés sur des modèles virtuels issus de tomographie, numérisation de surfaces ou capture de mouvement, ainsi que sur d'autres jeux de données (SIG, registres fossiles). Une large part de nos analyses repose sur des scripts développés en interne.

L'unité, localisée sur le campus Sud de Poitiers, est composée de 34 membres dont 1/3 de personnels CNRS. PALEVOPRIM dispose d'une plateforme technique en cours de certification intégrant plusieurs équipements d'acquisition et de traitements de données.

La personne recrutée s'intégrera dans un environnement stimulant, résolument tourné vers l'acquisition de nouvelles méthodologies. Elle sera rattachée au directeur de l'unité. Elle bénéficiera d'un soutien fort à la formation.

Cette fonction ouvre droit à la perception de l'Indemnité de Référence pour les Informaticiens (IRI).

Contact : Gildas Merceron - DU PALEVOPRIM ([e-mail])