Stage de Master 2 en génétique végétale - H/F

INRAE; Dijon; Sur place; EUR 20 000 - 40 000; Plein temps

Résumé du poste

Un institut de recherche national recherche un(e) stagiaire pour analyser la diversité génétique des légumineuses. Les responsabilités incluent l’analyse des données de génotypage et la participation à une saison de phénotypage. Un Master en génétique est requis, et des compétences en analyse de données sont appréciées. Le lieu de travail est à Dijon avec des avantages variés tels que le télétravail et des congés généreux.

Prestations

30 jours de congés + 15 RTT

Formations et développement des compétences

Prise en charge des frais de déplacement

Accès à des activités sportives et culturelles

Télétravail autorisé sous certaines conditions

Qualifications

• Connaissances en génétique et biologie végétale.
• Expérience appréciée en veille bibliographique et rédaction de rapports.
• Aptitudes à communiquer et à analyser des données.

Responsabilités

• Analyser les données de génotypage et décrire la diversité moléculaire.
• Rassembler, vérifier et standardiser les données de phénotypage.
• Relier la diversité moléculaire à la diversité phénotypique par GWAS.

Connaissances

Analyse de données

Rigueur

Observation des plantes

Communication

Travail en équipe

Formation

Master 2 en génétique et amélioration des plantes

Outils

Outils statistiques

Bases en génomique

Description du poste

Présentation INRAE

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

Environnement de travail, missions et activités

Vous serez accueilli(e) au sein de l’équipe Espèces Cibles Protéagineuses (ECP), appartenant à l’Unité de Recherche Mixte (UMR) Agroécologie basée à Dijon. L’équipe ECP conduit des projets de recherche sur l’adaptation des légumineuses à graines aux conduites agroécologiques, en lien avec les besoins de productions durables de protéines pour l’alimentation humaine et animale, ainsi que le développement de systèmes de culture agroécologiques.

La mobilisation de la diversité génétique des espèces cultivées est un levier déterminant pour fournir des variétés adaptées aux systèmes de production agricole actuels et futurs. Au sein de l’UMR Agroécologie, l’équipe ECP conserve, caractérise et valorise la collection nationale de ressources génétiques de légumineuses à graines (CRB PROTEA). Ce centre de ressources génétiques comprend 15 000 accessions patrimoniales de pois, féverole, lupin et lentille et constitue le réservoir dans lequel les chercheurs et sélectionneurs de légumineuses à graines puisent la diversité génétique nécessaire aux programmes de recherche et aux créations variétales innovantes.

Cette diversité de variétés ou de géniteurs doit permettre de répondre (i) aux contraintes du changement climatique et des multiples stress biotiques et abiotiques que ces espèces rencontrent dans les nouveaux systèmes de culture à faibles intrants, et (ii) aux attentes de valorisation pour une diversité d’usages alimentaires.

L’objectif général de votre stage

Vous évaluerez la diversité génétique présente dans la collection patrimoniale de pois, afin d’évaluer sa richesse et sa représentativité, de contribuer à la curation de la collection et de relier les données génotypiques aux variabilités phénotypiques mesurées. Vous participerez à une saison de phénotypage en serre pour vous familiariser avec la collection et les notations réalisées.

Vous serez plus particulièrement en charge de

• Analyser les données de génotypage pour décrire la diversité moléculaire de la collection et constituer des core‑collections.
• Rassembler les données de phénotypage, les vérifier et les standardiser; analyser la diversité phénotypique mesurée lors des mises en culture des accessions de la collection.
• Identifier les génotypes très proches sur bases génétiques et vérifier, sur la base des phénotypes, la pertinence de leur conservation.
• Relier la diversité moléculaire à la diversité phénotypique par une approche d’association pangénomique (Genome‑Wide Association study, GWAS).

Stage proposé

Le(la) candidat(e) devra avoir un goût pour l’analyse de données ; il.elle devra faire preuve de rigueur, d’un bon sens de l’observation des plantes et d’un intérêt pour l’étude de la diversité végétale.

Formations et compétences recherchées

Master/Ingénieur (Bac+5)

Formation recommandée : Master 2 en génétique et amélioration des plantes.

Connaissances souhaitées : génétique, biologie végétale, statistiques, bases en génomique.

Expérience appréciée : veille bibliographique et rédaction de rapports.

Aptitudes recherchées : bon sens de l’organisation, rigueur, aptitude à communiquer, aptitude à travailler en équipe, capacité à analyser des données.

Votre qualité de vie à INRAE

• jusqu’à 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein)
• dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle
• accompagnement social et prestations : conseil et écoute, aides et prêts sociaux, CESU etc.
• prestations vacances, loisirs, activités sportives, culturelles, familiales : chèque‑vacances, hébergements à tarif préférentiel ; billetterie aux tarifs préférentiels
• restauration collective avec une aire de pique‑nique
• prise en charge partielle par l’employeur des frais de déplacement domicile‑travail
• télétravail autorisé sous conditions définies par la NS en vigueur
• remboursement d'une part des cotisations de protection sociale complémentaire
• billet congé annuel SNCF
• accès facile au Centre INRAE Dijonnais par le tram, le bus + parkings vélos, voitures
• accueil au sein de l’association dijonnaise FMR² (Fraîchement et Momentanément Recruté·s dans la Recherche)

Modalités pour postuler

Transmettre une lettre de motivation et un CV à Mathieu CHANIS et Judith BURSTIN.

E-mail : [e-mail], [e-mail]
ou
Courrier : 17 rue Sully, 21000 Dijon

Les personnes accueillies à INRAE, établissement public de recherche, sont soumises aux dispositions du Code de la fonction publique notamment en ce qui concerne l’obligation de neutralité et le respect du principe de laïcité. En exercice de leurs fonctions, qu’elles soient ou non au contact du public, elles ne doivent pas manifester leurs convictions, par leur comportement ou leur tenue, qu’elles soient religieuses, philosophiques ou politiques.

En savoir plus : site fonction publique.gouv.fr