Régulation de l'expression des gènes par l'acétylation et la lactylation des protéines histones

CEA; Grenoble; Sur place; EUR 27 000 - 32 000; Plein temps

Résumé du poste

Un institut de recherche renommé à Grenoble recherche un doctorant pour une thèse sur la régulation de l'expression des gènes via l'acétylation et la lactylation des protéines histones. Le candidat idéal doit avoir des connaissances en bioinformatique et en mathématiques appliquées. Le projet implique l'étude de mécanismes complexes ayant des implications dans diverses maladies. La date de début est prévue pour le 1er octobre 2026.

Qualifications

• Formation en bioinformatique spécifiquement adaptée à la recherche en sciences du vivant.
• Connaissances solides en mathématiques appliquées pour l'analyse de données.
• Capacité à travailler sur des modèles de réseaux de neurones.

Responsabilités

• Étudier le rôle des lactylations sur le programme transcriptionnel.
• Contribuer à déchiffrer le 'langage histone'.
• Intégrer des données épigénomiques dans des modèles analytiques.

Connaissances

Bioinformatique

Mathématiques appliquées

Formation

Niveau Master en Biologie ou domaine connexe

Description du poste

Description du sujet de thèse

Thèse

Domaine

Sciences du vivant

Sujets de thèse

Régulation de l'expression des gènes par l'acétylation et la lactylation des protéines histones

Contrat

Thèse

Description de l'offre

Dans les cellules eucaryotes, l'ADN s'enroule autour de protéines histones pour former la chromatine. La modification dynamique des histones par diverses structures chimiques permet de réguler finement l'expression des gènes. Des altérations dans ces mécanismes complexes de régulation sont à l'origine de nombreuses maladies. L'acétylation des lysines d'histones est connue pour induire l'expression des gènes. D'autres structures peuvent être ajoutées sur les histones, dont les effets sur la transcription restent largement à élucider. La plupart d'entre elles, comme la lactylation découverte en 2019, dépendent du métabolisme cellulaire. Nous étudions cette nouvelle modification dans la spermatogenèse murine : ce processus de différentiation cellulaire constitue en effet un modèle de choix pour étudier la régulation de la transcription, du fait de changements spectaculaires dans la composition de la chromatine et dans le programme d'expression génique. Nous avons établi la distribution sur le génome de marques acétylées et lactylées sur trois lysines de l'histone H3. L'objet de cette thèse est de contribuer au déchiffrage du "langage histone", d'abord en étudiant le rôle des lactylations sur le programme transcriptionnel. Ensuite, la prédiction d'états chromatiniens sera raffinée en intégrant nos nouvelles données à de nombreuses données épigénomiques disponibles, au sein de modèles de réseaux de neurones.

Université / école doctorale

Chimie et Sciences du Vivant (EDCSV)
Université Grenoble Alpes

Site

Grenoble

Formation recommandée

bioinformatique, mathématiques appliquées

Disponibilité du poste

01/10/2026

Personne à contacter par le candidat

Delphine PFLIEGER
[e-mail]
CNRS
UA13 Inserm/CEA/Université Grenoble Alpes
EDYP/BGE/DS/IRIG
CEA de Grenoble
17 rue des Martyrs
38054 GRENOBLE cedex 09
0438782265

Tuteur / Responsable de thèse

Delphine PFLIEGER
[e-mail]
CNRS
UA13 Inserm/CEA/Université Grenoble Alpes
EDYP/BGE/DS/IRIG
CEA de Grenoble
17 rue des Martyrs
38054 GRENOBLE cedex 09
0438782265

En savoir plus

https://www.edyp.fr/web/research-activity/histone/
https://www.bge-lab.fr/Pages/Presentation.aspx