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INRAE; Villenave-d'Ornon; Sur place; EUR 40 000 - 60 000; Plein temps

Résumé du poste

Une institution de recherche publique recherche un(e) chercheur(e) sur le microbiome de la vigne pour une mission temporaire de 18 mois. Le candidat idéal possède un doctorat en écologie microbienne et une expertise en analyses bioinformatiques et metabarcoding. Vous effectuerez des suivis expérimentaux, encadrerez du personnel, et communiquerez des résultats scientifiques. La salaire est compris entre 2800€ et 3500€ selon expérience, basé à Villenave-d'Ornon.

Qualifications

• Formation recommandée : Thèse en écologie microbienne, ou interaction plante-microorganismes.
• Connaissances sur le microbiome des plantes et ses méthodes d’analyse (metabarcoding).
• Expérience en programmation R et biostatistiques appréciée.

Responsabilités

• Effectuer un suivi expérimental et des campagnes de prélèvements sur les parcelles.
• Réaliser des analyses bioinformatiques et biostatistiques des données.
• Rédiger les publications et communiquer les résultats lors des réunions.

Connaissances

Rigueur

Motivation

Esprit d’équipe

Bon relationnel

Formation

Doctorat en écologie microbienne

Outils

Programmation R

Analyses metabarcoding

HPC

Git/Gitlab

Description du poste

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

Environnement de travail, missions et activités

Vous serez accueilli(e) au sein de l’équipe ‘Rooti’ (pour Root interactions) de l’UMR ‘Ecophysiologie et Génomique fonctionnelle de la Vigne’ (EGFV) aussi bien que de l’UMR ‘Santé et Agroécologie au Vignoble’ (SAVE) sur le site INRAE de Nouvelle Aquitaine-Bordeaux (Villenave d’Ornon). Les UMR EGFV et SAVE collaborent sur l’étude du microbiome de la vigne pour l’objectif commun d’identifier les traits de la plante en lien avec les biomarqueurs microbiens de l’état de santé des écosystèmes viticoles.

Vous valoriserez vos résultats sous forme de communications scientifiques et techniques, participerez à des actions de transfert vers la profession via la contribution à des articles de vulgarisation des résultats scientifiques, et contribuerez à l’encadrement d’un(e) technicien(ne) qui sera recruté(e) sur cette thématique.

• Vous serez plus particulièrement en charge de :
• Formuler des hypothèses de recherche pouvant être testées avec les jeux de données déjà acquis :
  • Effectuer un suivi expérimental et des campagnes de prélèvements sur les différentes parcelles.
  • Encadrer un(e) technicien(ne) et réaliser les analyses moléculaires au laboratoire.
  • Réaliser les analyses bioinformatiques et biostatistiques des jeux de données préliminaires et ceux obtenus lors des expérimentations en cours, permettant de tester les hypothèses.
• Rédiger les publications correspondantes :
  • Communiquer les résultats obtenus dans les réunions de projet et des conférences.
  • Contribuer à la vie scientifique des deux équipes, en participant aux animations et partageant vos connaissances et vos compétences.
• Travail en laboratoire, travail à l’écran ; déplacements en Champagne, Val de Loire, Cognac ; prélèvements sur le terrain.

Formations et compétences recherchées

Doctorat/Ingénieur grandes écoles

• Formation recommandée : Thèse en écologie microbienne, ou interaction plante-microorganismes.
• Connaissances souhaitées : Connaissances sur le microbiome des plantes et ses méthodes d’analyse (metabarcoding) ; biostatistiques.
• Expérience appréciée : Programmation R, analyse metabarcoding, utilisation d’une infrastructure de calcul type HPC et git/gitlab pour la gestion de projet d’analyse.
• Aptitudes recherchées : Rigueur, motivation, esprit d’équipe et bon relationnel ; permis B.

Votre qualité de vie à INRAE

En rejoignant INRAE, vous bénéficiez (selon le type de contrat et sa durée) :

Les personnes accueillies à INRAE, établissement public de recherche, sont soumises aux dispositions du Code de la fonction publique notamment en ce qui concerne l’obligation de neutralité et le respect du principe de laïcité. À ce titre, dans l’exercice de leurs fonctions, qu’elles soient ou non au contact du public, elles ne doivent pas manifester leurs convictions, par leur comportement ou leur tenue, qu’elles soient religieuses, philosophiques ou politiques. En savoir plus : site fonction publique.gouv.fr.

Référence de l'offre

• Contrat : Mission temporaire
• Durée : 18 mois
• Début du contrat : 01/03/2026
• Rémunération : entre 2800€ et 3500€ selon expérience

UMR Ecophysiologie et Génomique fonctionnelle de la Vigne (EGFV)