Ingénieur-e en expérimentation et instrumentation biologiques H/F

CNRS; Montpellier; Sur place; EUR 35 000 - 45 000; Plein temps

Résumé du poste

Un institut de recherche scientifique à Montpellier recrute un Ingénieur-e en expérimentation et instrumentation biologiques. Le candidat doit avoir des compétences en techniques de dissection, imagerie 2D/3D et analyse d'images. Des connaissances en biologie et en anatomie des vertébrés sont essentielles. Ce poste implique la gestion d'échantillons biologiques et la collaboration avec plusieurs équipes. Un bon niveau d'anglais est requis. Contrat à durée indéterminée, encadré par des chercheurs expérimentés.

Prestations

Travail dans un environnement de recherche dynamique

Collaboration avec des équipes interdisciplinaires

Qualifications

• Connaissances en biologie générale et en anatomie des vertébrés.
• Maîtrise des techniques de dissection sur vertébrés.
• Capacité à travailler en équipe et sens du collectif.

Responsabilités

• Effectuer des dissections de vertébrés et préparer des échantillons.
• Mettre en œuvre des techniques d'imagerie 2D et 3D.
• Rédiger et actualiser des fiches techniques.

Connaissances

Techniques de dissection sur vertébrés

Techniques de préparation d'échantillons

Techniques d'imagerie (photo macro, microscopie)

Analyse d'images (Fiji, Avizo)

Morphométrie géométrique

Bon niveau d'anglais (B1 à B2)

Formation

Diplôme en biologie ou domaine connexe

Outils

Fiji

Avizo

Amira

MorphoDig

ZEN

LAS

Description du poste

Ingénieur-e en expérimentation et instrumentation biologiques H/F

Date Limite Candidature : jeudi 15 janvier 2026 17:00:00 heure de Paris

Informations générales

Réservé uniquement aux agents CNRS (fonctionnaires et CDI)
Intitulé de l'offre : Ingénieur-e en expérimentation et instrumentation biologiques H/F
Référence : UMR5554-MOBINT-K55004
Lieu de travail : MONTPELLIER
Institut : INEE - Institut d'écologie et environnement
Date de publication : mardi 2 décembre 2025
Session : Campagne Hiver 2026
Groupe de Fonction : IEG3
BAP : A - Sciences du vivant, de la terre et de l'environnement
Emploi type : Ingenieure ou ingenieur en experimentation et instrumentation biologiques

Missions

Phénotypage de la morpho-anatomie des vertébrés et imagerie 2D et 3D : mettre en œuvre des techniques spécialisées pour obtenir des échantillons biologiques et les analyser au travers de techniques d'imagerie allant de l'organisme aux cellules.

Activités

• Dissection de vertébrés euthanasiés ou conservés en formol / éthanol – inclut la dissection fine de structures anatomiques particulières, prélèvement, préparation (nettoyage, fixation, coloration) et conditionnement des échantillons (organisme entier, pièce squelettique, organe, structure fossilisée) pour différentes techniques de phénotypage
• Imagerie 2D : photographie macro, loupe binoculaire, microscopie en lumière blanche ou confocale
• Imagerie 3D : microtomographie par rayons X, photogrammétrie
• Analyse d'images : segmentation et reconstructions 3D, dissection virtuelle, morphométrie géométrique
• Veille technologique et intégration des outils d'intelligence artificielle dans l'analyse d'images 2D et/ou 3D
• Entretien et maintenance de premier niveau du matériel, gestion et élimination des déchets selon les règles d'hygiène et sécurité, gestion des stocks et des commandes de consommables
• Rédaction/actualisation des fiches de préparation et de protocoles techniques
• Initiation des utilisateurs aux techniques du domaine et aux équipements du laboratoire

Compétences

Savoirs :

• Connaissances en biologie générale et en anatomie des vertébrés
• Connaissances de la réglementation en matière d'hygiène et de sécurité

Savoir-faire :

• Maîtrise des techniques de dissection sur vertébrés
• Maîtrise de diverses techniques de préparation d'échantillons à imager (fixation, coloration de contraste, montage,...)
• Maîtrise de diverses techniques d'imagerie (photo macro, diverses techniques de microscopie [confocale, en lumière blanche, autres], microtomographie aux rayons X)
• Expérience dans l'utilisation de logiciels d'analyse d'images (Fiji, Avizo, Amira, MorphoDig, ZEN, LAS)
• Expérience en analyse des données morphologiques : morphométrie géométrique, analyse de contours, traitement statistique des données morphologiques et logiciels associés (R, Rstudio)
• Expérience dans le transfert des connaissances et formation des utilisateurs, incluant l'écriture de protocoles
• Gérer et organiser les données produites
• Organiser et gérer les priorités
• Savoir informer et rendre compte, à l'oral comme à l'écrit
• Bonne expression écrite et orale en anglais : niveau B1 à B2 (cadre européen commun de référence pour les langues)

Savoir-être :

• Motivation / Rigueur / Fiabilité
• Sens de l'organisation
• Capacité à travailler en équipe et sens du collectif
• Capacité d'adaptation et d'innovation
• Aisance relationnelle

Compétences considérées comme un plus :

• Connaissances sur l'utilisation de l'intelligence artificielle dans l'analyse d'images

Contexte de travail

L'Institut des Sciences de l'évolution de Montpellier (l'ISEM) développe depuis plus de 40 ans des recherches sur l'origine et la dynamique de la biodiversité et sur les modalités et les mécanismes de son évolution. Ses recherches sur les questions fondamentales de la biologie évolutive concernent tout autant la biodiversité actuelle que passée, portent sur un large éventail d'organismes et de milieux et allient approches de terrain, expérimentales et théoriques.

La description des processus et des patrons évolutifs passe par le phénotypage des individus pour leur comparaison au sein des, ou entre les espèces. A l'ISEM, la description des phénotypes est mise en œuvre à diverses échelles et chez divers types d'organismes.

Rattachée au plateau technique mutualisé 'Morpho-anatomie des Vertébrés' du service commun 'Morpho' de l'ISEM, la personne recrutée collaborera avec toutes les équipes de l'ISEM développant des projets nécessitant un soutien technique en morpho-anatomie des vertébrés. Il/Elle sera sous la responsabilité hiérarchique d'un(e) chercheur(e)/enseignant(e)-chercheur(e) affilié(e) à l'une des principales équipes collaborant avec le plateau 'Morpho-anatomie des Vertébrés'.

Le plateau propose des espaces pour la dissection d'organismes vertébrés (y compris sous la loupe), la préparation des échantillons (dissection, fixation, coloration), la mise en œuvre de techniques d'imagerie 2D et 3D et l'analyse d'images.

Sur ce plateau, les utilisateurs préparent leurs échantillons en vue de diverses techniques de marquage et ou d'imagerie : microtomographie (cf plateau 'Microtomographie' de l'ISEM), histologie (cf plateau RHEM de l'UAR Biocampus), microscopie en lumière blanche ou confocal (cf plateau MRI de l'UAR Biocampus).

La personne recrutée devra faire la liaison avec les plateformes d'imagerie du campus hors unité, notamment la plateforme Montpellier Ressources Imagerie (MRI) de l'UAR Biocampus et avec les autres plateaux techniques de l'ISEM.