Data Manager pour la Gestion des Données Multimodales du Projet Milieu Intérieur H / F

INSTITUT PASTEUR; Boulogne-Billancourt; Hybride; EUR 45 000 - 60 000; Plein temps

Résumé du poste

Un institut de recherche biomédicale à Boulogne-Billancourt recherche un(e) data manager pour gérer des ensembles de données biologiques. Le candidat idéal aura un Master en bio-informatique et au moins 3 ans d'expérience, ainsi qu'une expertise en R, Python, et SQL. Ce poste offre une politique de congés favorable, la possibilité de télétravail, et un environnement multiculturel.

Prestations

Politique de congés favorable

Télétravail possible

Cafétéria et restaurant d'entreprise

Mutuelle familiale

Salles de sport

Qualifications

• Minimum 3 ans d'expérience dans le domaine.
• Maîtrise de l'anglais, niveau B2.
• Expérience en gestion de grands ensembles de données.

Responsabilités

• Traiter et gérer le cycle de vie de grands ensembles de données biologiques.
• Développer des outils facilitant l'accès aux données.
• Préparer les jeux de données pour leur partage avec des laboratoires extérieurs.

Connaissances

R

Python

SQL

Unix shell

Communication en équipe

Gestion de données

Formation

Master en bio-informatique

Outils

HPC (calcul à haute performance)

Description du poste

Le projet Milieu Intérieur est une étude de cohorte ambitieuse visant à analyser l'impact de la génétique et de l'environnement, ainsi que leurs interactions, sur le système immunitaire humain. Ses objectifs sont d'établir une compréhension approfondie de la variation immunitaire dans la population générale, et de déterminer le rôle de la génétique, du vieillissement, de la consommation de tabac, ou du microbiote dans la régulation des programmes immunitaires.

Responsabilités

• La ou le data manager traitera et gérera le cycle de vie de grands ensembles de données biologiques (génomes humains, transcriptomes, epigénomes, microbiomes, etc.) et développera des outils facilitant l'accès aux données pour le projet, en lien avec la Plateforme de Data Management de l'Institut Pasteur.
• Gestion de multiples données omics générées par le Consortium Milieu Intérieur, en collaboration avec les coordonnateurs et les bioinformaticiens du Consortium.
• Développement d'outils en ligne permettant d'explorer les résultats résumés du Milieu Intérieur afin de promouvoir la science ouverte.
• Préparation des jeux de données documentés en vue de leur partage avec des laboratoires extérieurs, afin de promouvoir la reproductibilité de la science.
• Dépôt de l'ensemble des données omics sur Owey, le datalake de l'Institut Pasteur.

Profil recherché et qualifications

• Diplôme : Master en bio-informatique.
• Expérience : minimum 3 ans d'expérience.
• Maîtrise de l'anglais, niveau B2.
• Maîtrise des langages de programmation (R, Python, SQL, Unix shell); une expérience en HPC (calcul à haute performance) serait appréciée.
• Maîtrise des bonnes pratiques de gestion de grands ensembles de données et compétences dans le traitement de grands ensembles de données.
• Grande capacité à travailler en équipe et à centraliser l'information dans un milieu très collaboratif.
• Bonne communication avec les membres de l'équipe.

Conditions et environnement de travail

• Politique de congés et RTT très favorable (Forfait 204 jours).
• Possibilité de télétravail.
• Forfait mobilité douce ou remboursement de 75% des titres de transport.
• Cantine d'entreprise, restaurant, cafétérias.
• Mutuelle familiale (gratuité conjoints / enfants) et service de santé pour les collaborateurs sur le campus.
• Salles de sport, 30 activités culturelles / artistiques / sportives sur le campus.
• Engagements RSE forts et initiatives des collaborateurs encouragées.
• Environnement multiculturel (plus de 75 nationalités sur le campus).