Data Scientist (m/w/d) / Bioinformatiker (m/w/d)

Universitätsklinikum Erlangen; Erlangen; Vor Ort; EUR 50.000 - 70.000; Vollzeit

Zusammenfassung

Eine renommierte medizinische Einrichtung in Erlangen sucht einen engagierten Bioinformatiker (m/w/d) zur Verstärkung des Forschungsteams. In dieser Rolle sind Sie verantwortlich für das Forschungsdatenmanagement, die bioinformatische Analyse und die Veröffentlichung wissenschaftlicher Ergebnisse. Erwartet wird ein abgeschlossenes Studium in Bioinformatik oder einem verwandten Fachbereich sowie Erfahrung in der Arbeit mit biologischen Datensätzen. Das Angebot umfasst eine krisensichere Anstellung mit Tarifvertrag und umfangreichen Sozialleistungen.

Leistungen

Gesundheitsförderung

Vereinbarkeit von Beruf und Familie

Tarifvertrag

Qualifikationen

• Erfahrung mit biomedizinischen Daten und deren Standards.
• Vertraut mit FAIR-Prinzipien.
• Kenntnisse in Statistik und Machine Learning.

Aufgaben

• Forschungsdatenmanagement gemäß FAIR-Prinzipien.
• Bioinformatische Analyse von Omics-Datensätzen.
• Erstellung und Veröffentlichung wissenschaftlicher Publikationen.

Kenntnisse

Teamfähigkeit

Strukturierte Arbeitsweise

Selbstständigkeit

Ausbildung

Abgeschlossenes Studium in Bioinformatik oder verwandter Fachrichtung

Tools

Python

R

Snakemake

Nextflow

Jobbeschreibung

Klingt spannend?

Das Sind Wir

Das Universitätsklinikum Erlangen steht für exzellente Patientenversorgung, innovative Forschung und eine hochwertige medizinische Ausbildung. Mit über 9.800 qualifizierten Mitarbeitenden zählt das Klinikum zu den größten Arbeitgebern in Mittelfranken und trägt durch kontinuierliche Weiterentwicklung maßgeblich zum medizinischen Fortschritt bei.

Im Rahmen des Transregio-Forschungsverbunds TRR 417 „Zelluläre Kommunikation im Stroma des kolorektalen Karzinoms: Von der Pathophysiologie bis zur klinischen Translation“ kooperieren die Universitätskliniken Erlangen, Frankfurt und Freiburg intensiv. Ziel des Verbunds ist es, die komplexen Interaktionen im Tumormikromilieu des kolorektalen Karzinoms eingehend zu erforschen und innovative Therapieansätze zu entwickeln.

Durch diese interdisziplinäre Spitzenforschung schaffen die beteiligten Universitätskliniken die wissenschaftliche Grundlage für verbesserte Behandlungsmöglichkeiten sowie eine nachhaltige Optimierung der Versorgung von Patientinnen und Patienten mit kolorektalem Karzinom. Gestalten Sie mit uns gemeinsam die Zukunft der Medizin und werden Sie Teil unseres engagierten Teams.

Die Aufgaben

• Forschungsdatenmanagement (RDM) gemäß FAIR-Prinzipien zur Sicherstellung langfristiger Datenverfügbarkeit und -nachnutzbarkeit
• Bioinformatische Analyse und Integration von Single-Cell-, Bulk-RNA-seq-, Metabolomics und weiteren Omics-Datensätzen im Rahmen des TRR417
• Entwicklung und Anwendung statistischer Methoden zur Auswertung großskaliger biologischer Datensätze
• Visualisierung und Interpretation komplexer molekularbiologischer Ergebnisse in enger Zusammenarbeit mit experimentellen Partnern
• Erstellung und Veröffentlichung wissenschaftlicher Publikationen sowie Präsentation der Ergebnisse auf internen und externen Fachveranstaltungen
  
  

Das Know-how dafür

• Abgeschlossenes Studium (Master oder Promotion) in Bioinformatik, Computational Biology, Data Science oder einer verwandten Fachrichtung
• Vertraut mit den FAIR-Prinzipien und deren praktischer Umsetzung
• Erfahrung mit biomedizinischen Daten und Metadatenstandards (z. B. MIAME, MINSEQE, OME)
• Praxis in Datenversionierung (z. B. Git) und Workflow-Management (z. B. Snakemake, Nextflow)
• Erfahrung in der Analyse von Hochdurchsatzdaten (z. B. RNA-seq, Single-Cell Omics)
• Sicherer Umgang mit Python und/oder R sowie gängigen Bioinformatik-Frameworks (z. B. Scanpy, Seurat, Bioconductor)
• Vertiefte Kenntnisse in Statistik und Machine Learning, idealerweise mit Erfahrung in Graph Neural Networks (GNNs)
• Ausgeprägte Teamfähigkeit, selbstständige und strukturierte Arbeitsweise sowie Freude an interdisziplinärer Zusammenarbeit
  
  

Das Bieten Wir

• Einen krisensicheren Arbeitsplatz mit allen Annehmlichkeiten eines Tarifvertrages, inkl. Zusatzvorsorge der Versorgungsanstalt des Bundes und der Länder (VBL), bei uns als systemrelevanter Arbeitgeber im öffentlichen Dienst
• Eine interessante Tätigkeit in einem motivierten, aufgeschlossenen Team
• Sorgfältige und qualifizierte Einarbeitung
• Ein umfassendes Angebot zur Gesundheitsförderung
• Beabsichtigte Eingruppierung, je nach Qualifikation und persönlichen Voraussetzungen, gemäß TV-L
• Es handelt sich um eine Vollzeitstelle, diese ist grundsätzlich auch teilzeitfähig
  
  

Alle Benefits am UKER

Arbeiten am UKER

Wir zählen zu den besten Krankenhäusern Deutschlands und sind einer der größten Arbeitgeber in Mittelfranken. Diesen Erfolg erarbeiten tagtäglich unsere über 9.800 hoch qualifizierten Beschäftigten in unterschiedlichsten Berufen. Wir als Uniklinikum Erlangen wissen, dass alle unsere Beschäftigten wichtig sind, damit auch in Zukunft modernste Medizin, ausgezeichnete Forschung und Patientenversorgung auf höchstem Niveau gelingen.

Wenn Sie sich eine Tätigkeit mit einem hohen sozialen Wert wünschen und die Welt der Spitzenmedizin mit uns gemeinsam gestalten und ermöglichen möchten, dann sind Sie bei uns richtig!

Hinweise zu Impfungen Das UKER als Arbeitgeber

Was meinen Sie? Passen wir zu Ihnen und Sie zu uns ans Uniklinikum Erlangen?

Jetzt bewerben

Arbeiten am Puls der Medizin

Sinnvoll und systemrelevant

Berufliche Perspektiven

Vorteile eines Tarifvertrages