Responsable de l’activité de transcriptomique spatiale (CDD)

IGBMC; Strasbourg; Sur place; EUR 100 000 - 125 000; Plein temps

Résumé du poste

Un institut de recherche en biologie situé à Strasbourg recherche un expert en transcriptomique spatiale pour piloter des projets et gérer des prestations de service. Le candidat idéal possède des compétences en histopathologie, techniques d'imagerie, et maîtrise l'anglais scientifique. Ce poste implique également la définition de protocoles et un travail en collaboration avec des équipes scientifiques. Rejoignez une équipe dynamique au cœur de la recherche.

Qualifications

• Bonnes connaissances en histopathologie et en techniques d’imagerie.
• Connaissances générales en biologie cellulaire et moléculaire.
• Expérience significative en histologie, immunomarquage et microscopie à fluorescence.

Responsabilités

• Gérer les prestations de service en vigueur sur la plateforme.
• Piloter les projets de développement de la transcriptomique spatiale.
• Garantir une documentation adéquate et une traçabilité complète des activités.

Connaissances

Histopathologie

Techniques d'imagerie

Biologie cellulaire et moléculaire

Transcriptomique

Anglais scientifique

ISO 9001

Outils

Image J

Séquenceur Illumina

Description du poste

La plateforme GenomEast, hébergée à l’Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire (IGBMC) et membre de l’infrastructure nationale « France Génomique » fournit une expertise, des services, et réalise des développements en transcriptomique, épigénétique et génomique pour l’ensemble de la communauté scientifique nationale et internationale.

En collaboration avec le service d’histopathologie de la Clinique de la Souris, la plateforme d’imagerie de l’IGBMC et le projet européen de collaboration P4Health, GenomEast souhaite aujourd’hui renforcer son activité de transcriptomique spatiale en recherche fondamentale et translationnelle.

Activités

• Gérer les prestations de service en vigueur sur la plateforme
• Piloter les projets de développement (conception, mise en œuvre, suivi, analyse, compte rendu)
• Conduire la mise en production des nouveaux développements retenus
• Diffuser et valoriser les résultats des projets de développement auprès des collaborateurs de la plateforme et au sein des réseaux professionnels auxquels elle appartient (site internet, poster, présentation orale, publication)
• Réaliser une veille scientifique et technologique en lien avec la transcriptomique spatiale
• Préparer des protocoles détaillés et établir des procédures opératoires standardisées (SOP) pour la réalisation des études de transcriptomique spatiale et garantir une analyse et un reporting de haute qualité
• Définir les contrôles qualité nécessaires aux différentes étapes des expérimentations
• Collaborer avec les équipes scientifiques et les acteurs des institutions partenaires P4Health pour adapter les méthodologies en fonction des résultats des projets et des défis émergents
• Fournir un accompagnement scientifique et un support de dépannage aux équipes et aux partenaires P4Health
• Garantir une documentation adéquate et une traçabilité complète des activités des projets, à des fins d’audit et de dévaluation, conformément aux standards FAIR

Compétences techniques

Connaissances

• Bonnes connaissances en histopathologie et en techniques d’imagerie
• Connaissances générales en biologie cellulaire et moléculaire
• Connaissances de base des approches en transcriptomique, génomique et / ou épigénétique par séquençage à haut débit
• Connaissance du fonctionnement des plateformes de recherche en sciences du vivant
• Maîtrise de langlais scientifique à loral et à l’écrit
• Connaissance générale de la Norme ISO 9001

Compétences opérationnelles

• Expérience significative en histologie, immunomarquage et microscopie à fluorescence
• Expérience pratique de la gestion et de l’analyse d’images microscopiques (Exemple Image J)
• Maîtrise des techniques générales de biologie moléculaire (extraction, purification, hybridation, marquage, amplification d’acides nucléiques)
• Une première expérience sur le pilotage d’un séquenceur Illumina ou sur la préparation de banque de séquençage haut débit serait un plus.

Compétences comportementales

• Capacité de synthèse et de présentation à loral et à l’écrit.
• Capacité à transmettre un savoir-faire technique
• Aptitude au dialogue avec des scientifiques issus de différents domaines
• Rigueur et organisation
• Sens du service
• Respect des règles de déontologie et de confidentialité
• Planification et gestion des priorités
• Esprit critique et curiosité scientifique
• Travail en équipe