Profils d’expression génique des cellules vasculaires cérébrales par séquençage ARN profond

SFBI; Nantes; Sur place; EUR 40 000 - 60 000; Plein temps

Résumé du poste

Une organisation de recherche biomédicale à Nantes recherche un stagiaire pour analyser les résultats de séquençage ARN et développer une base de données sur l'expression des gènes dans les artères cérébrales liées à l'anévrisme. Ce stage de 6 mois débute en février ou mars. Aucune expertise en biologie n'est requise ; un intérêt pour l'informatique appliquée à la santé est souhaité.

Qualifications

• Pas de compétences spécifiques en biologie requises.
• Intérêt pour l'application de l'informatique dans le domaine de la santé.

Responsabilités

• Analyser les résultats de séquençage ARN.
• Construire une base de données interrogeables et son interface utilisateur.

Description du poste

Profils d’expression génique des cellules vasculaires cérébrales par séquençage ARN profond

Contexte général et objectif du stage :

Le bon fonctionnement de nos organes dépend en parti de leur irrigation sanguine, rendue possible grâce à notre réseau vasculaire. Nos artères sont notamment adaptées pour permettre au sang d’atteindre nos organes et ont développé des mécanismes de réponses aux forces hémodynamiques générées par le frottement du sang sur la paroi. Les cellules vasculaires sont en effet capables de transformer les stimuli mécaniques en messages chimiques ce qui conduit à une régulation de leurs fonctions et de l’expression de leurs genes.
Une perturbation des forces hémodynamiques ou une modification de la capacité des cellules à percevoir ces forces compromettent la santé des artères. Cela se produit en particulier dans les zones de bifurcations qui, par leur conformation, sont le siège de contraintes hémodynamiques perturbées et constituent des zones de susceptibilité à des pathologies artérielles, notamment l’anévrisme intracrânien. Cette pathologie est caractérisée par une dilatation locale d’une artère cérébrale au niveau de sa bifurcation. La rupture de cette dilatation provoque une hémorragie cérébrale qui est mortelle dans 40% des cas.
Aujourd’hui la biologie de ces artères, en particulier lorsque l’anévrisme se forme, est mal connue limitant le développement de traitements pharmacologiques pour cette pathologie.
Parmi nos différents axes de recherche, notre équipe cherche actuellement à créer une base de données interrogeables sur l’expression des gènes et de leurs différents transcrits dans les artères cérébrales en condition physiologique et pathologique d’anévrisme intracrânien ainsi que dans des cellules vasculaires exposées à différentes forces hémodynamiques in vitro.

L’objectif du stage sera donc d’analyser les résultats de séquençage ANR et de construire la base de données interrogeables et son interface conviviale.

Ce stage ne demande pas de compétence en biologie mais une appétence pour l’application de l’informatique sur des thématiques de santé.

Début flexible février ou Mars, durée 6 mois.

Procédure : Envoyer un CV et Lettre de motivation aux deux adresses mail de contact.

Date limite : 31 janvier 2026

Anne-Clémence Vion
[e-mail]

Offre publiée le 21 novembre 2025, affichage jusqu'au 31 janvier 2026