Ingénieur bioinformaticien en analyse de transcriptome et de traductome

CNRS; Gif-sur-Yvette; Sur place; EUR 40 000 - 60 000; Temps partiel

Résumé du poste

Un institut de recherche est à la recherche d'un ingénieur bioinformaticien pour analyser des données de transcriptome et de traductome. Le poste implique la mise en place de pipelines Unix pour le traitement de données NGS et la maintenance de services en ligne. Les candidats doivent avoir un BAC+5 et des compétences en Python, R et en gestion de workflow. La mission se déroulera à Gif-sur-Yvette, dans un environnement bioinformatique dynamique.

Qualifications

• Connaissance des outils et concepts utilisés en analyse NGS.
• Capacité à gérer de nombreuses interactions et travailler sur des projets variés.

Responsabilités

• Analyse de données de transcriptome et de traductome.
• Déployer et maintenir des services bioinformatiques en ligne.
• Comparer des données de différents tissus.

Connaissances

Analyse de données NGS

Python

R

Gestionnaire de workflow

Docker

Singularity

Anglais (niveau B1)

Sens de la communication

curiosité

Formation

BAC+5

Description du poste

Ingénieur bioinformaticien en analyse de transcriptome et de traductome (H/F)

Intitulé de l'offre : Ingénieur bioinformaticien en analyse de transcriptome et de traductome (H/F)
Référence : UMR9198-DANGAU-010
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : GIF SUR YVETTE
Date de publication : jeudi 15 janvier 2026
Type de contrat : IT en contrat CDD
Durée du contrat : 16 mois
Date d'embauche prévue : 1 avril 2026
Quotité de travail : Complet
Rémunération : entre 2571 et 2742 euros bruts mensuels selon expérience
Niveau d'études souhaité : BAC+5
Expérience souhaitée : Indifférent
BAP : A - Sciences du vivant, de la terre et de l'environnement
Emploi type : Ingenieure ou ingenieur biologiste en traitement de donnees
Date Limite Candidature : jeudi 5 février 2026 23:59:00 heure de Paris
Assurez-vous que votre profil candidat soit correctement renseigné avant de postuler.

Missions

Analyse de données de transcriptome et de traductome et mise en place d'une ressource en ligne pour la recherche en immunologie.

Activités

• Mettre en place des pipelines Unix d'analyse de données NGS
• Comparer des données transcriptome/traductome de différents tissus
• Assurer le respect des principes FAIR des procédures informatiques
• Déployer et assurer la maintenance de services bioinformatiques en ligne sur différentes plateformes (cluster local, cloud, serveurs web)

Compétences

• Connaissance des outils et concepts utilisés en analyse NGS (genome/transcriptome/proteome)
• Maîtrise des langages Python et R
• Maîtrise d'au moins un gestionnaire de workflow
• Production de conteneurs Linux (Docker, Singularity)
• Bonne pratique de la maintenance de code et de la gestion de versions
• Anglais niveau B1
• Sens du relationnel et de la communication
• Curiosité, dynamisme
• Capacité à gérer de nombreuses interactions et à travailler sur des projets variés

Contexte de travail

Dans le cadre d'un projet financé par l'Agence de Recherche sur le Cancer (ARC) avec l'institut Curie et l'INSERM, nous étudions le transcriptome et le traductome de l'épithélium thymique, un tissu essentiel qui permet la reconnaissance du soi et du non-soi par le système immunitaire. L'ingénieur.e en bioinformatique sera en charge du traitement et de l'analyse des données NGS générées. Il/elle appliquera notamment des méthodes d'analyse sans référence, pour identifier toute la diversité des antigènes produits par ce tissu, puis comparer cette diversité à celle des autres tissus normaux. Nous exploiterons ces données pour déterminer si des antigènes de tumeur sont effectivement spécifiques des tumeurs. Enfin, nous mettrons ces données à disposition de la collectivité via un service web.

L'I2BC est un grand institut de biologie moléculaire et cellulaire situé dans un cadre très agréable à 25km de Paris (Gif sur Yvette). Notre équipe (Biologie computationnelle des génomes) fait partie du département de Biologie des Génomes. L'environnement bioinformatique local est très riche: forum de discussion, séminaires et formations en bioinformatique, plateforme bioinformatique et centre de calcul de haute performance.

Contraintes et risques

Travail sur poste informatique.