Ingénieur en biologie moléculaire et analyses de données F/H

INSTITUT DE RECHERCHE POUR LE DEVELOPPEMENT; Occitanie; Hybride; EUR 35 000 - 45 000; Plein temps

Résumé du poste

Un institut de recherche dans le domaine scientifique recherche un professionnel autonome en biologie moléculaire, avec des compétences en bio-informatique. Le poste nécessite l’utilisation d’outils tels que R et Python pour analyser les données de séquençage. Le candidat idéal doit être capable de travailler en équipe et d’interagir dans un environnement multiculturel. Des avantages tels que des jours de congé supplémentaires et la possibilité de télétravail sont offerts.

Prestations

32 jours de congés

Tickets restaurants ou restauration collective

Participation à la protection sociale

Cadre de travail agréable proche de la nature

Télétravail possible 1 à 3 jours par semaine

Qualifications

• Être autonome dans l’utilisation des techniques de biologie moléculaire.
• Utiliser les outils de bio-informatique pour analyser des données.
• Conduire des techniques de microbiologie classique.
• Rédiger des protocoles et des comptes rendus.
• Avoir un niveau d'anglais suffisante pour encadrer des étudiants.

Responsabilités

• Assurer la veille méthodologique en métagénomique.
• Réaliser des analyses de routine en biologie moléculaire.
• Conduire les analyses de données issues du séquençage.
• Gérer le laboratoire et les stocks.

Connaissances

Autonomie en biologie moléculaire

Utilisation d'outils de bio-informatique

Techniques de microbiologie classique

Rédaction de comptes rendus

Anglais niveau B1-B2

Formation

Formation approfondie en biologie moléculaire

Outils

R

Python

Description du poste

Vos Activités Seront Les Suivantes

• Assurer la veille méthodologique et la mise au point de méthodes en métagénomique (écologie synthétique, cultures microbiennes, approches « méta-omiques », préparation, suivi et contrôle des opérations de fermentation).
• Réaliser des analyses de routine en biologie moléculaire (extraction ADN, ARN, PCR en temps réel, séquençage à haut débit).
• Conduire les analyses de données issues du séquençage à haut débit (métagénomes alimentaires et intestinaux) en utilisant des outils de bio-informatique (Qiime 2, R, Python, Bash) y compris sur des clusters de calcul, du traitement des données à la visualisation.
• Favoriser l’articulation avec les structures opérationnelles et décisionnelles (plateformes de séquençage à haut débit, interactions avec les centres de ressources microbiennes).
• Rédiger des protocoles détaillés d’analyse et former les stagiaires et partenaires.
• Respecter et faire respecter les règles d'éthique, d'hygiène et sécurité.
• Participer à la gestion du laboratoire (commandes, suivi des stocks, maintenance).

Votre future équipe

Vous intègrerez une équipe multidisciplinaire composée de 6 chercheurs, 1 ingénieur de recherche, 2 ingénieurs d’études, 1 assistant ingénieur et 1 technicien. La multidisciplinarité des approches développées (épidémiologie, science des aliments) vous permettra d’interagir avec des collègues de différents domaines, tout en renforçant les aspects microbiologiques portés principalement par un chercheur de l’équipe.

Vous travaillerez en interactions fortes avec les membres de cette équipe ayant un effectif de taille restreinte ainsi qu’avec des membres d’autres équipes de l’UMR (par exemple en bioinformatique).

Vous partagerez un espace commun pour mener à bien les activités qui vous seront confiées, dans un collectif engagé et volontaire.

Vous interagirez avec des partenaires et étudiants du Sud dans un environnement multiculturel.

Le profil que nous recherchons

Vous Avez Développé Les Compétences Suivantes

• Être autonome dans la mise en œuvre des principales techniques de base de biologie moléculaire (extraction ADN, ARN, PCR en temps réel ou digitale, séquençage à haut débit).
• Avoir une expérience d’utilisation des outils de bio-informatique ainsi qu’en langages de programmation utilisés en analyses de données (R, Python).
• Mener les techniques de microbiologie classique.
• Rédiger des comptes rendus et des protocoles.
• Avoir un niveau de connaissance en anglais suffisant pour l’encadrement d’étudiants non francophones Niveau B1-B2.

Vous Faites Preuves Des Qualités Humaines Suivantes

• Vous êtes consciencieux, rigoureux et patient.
• Vous avez un goût prononcé pour le travail en équipe.
• Vous avez des capacités d’adaptation fortes à un nouveau collectif et un environnement multiculturel.

De formation approfondie en biologie moléculaire, une expérience en bio-informatique appliquée est essentielle.

En Rejoignant L’IRD, Vous Bénéficierez

• De 32 jours de congés + 13 RTT (pour un temps plein à 38h30 hebdomadaire).
• Tickets restaurants OU d’une restauration collective (en fonction du site).
• Souscription annuelle (facultative) à l’Association desŒuvres Sociales : prestations vacances-loisirs et sportives-culturelles.
• Participation à hauteur de 15€/mois pour la protection sociale.
• D’un cadre de travail agréable, proche de la nature, desservi par le Tram ligne 5 et accessible en vélo et bénéficiant d’un système de co-voiturage (convention mobilité signée avec la métropole).

Le poste est accessible aux fonctionnaires dont le corps est inférieur, égal ou supérieur au corps du poste.

L’IRD accompagne votre parcours professionnel par un panel d’outils tels que le parcours digital d’intégration, l’accès à la formation permanente, à la promotion et la mobilité.

L’institut offre, en fonction des activités, la possibilité de télétravailler de 1 à 3 jours hebdomadaires.