Chef de Projets Bio-Informaticien Maladies Rares F / H (CDI)

HADLEY SEARCH; Paris; Sur place; EUR 40 000 - 60 000; Plein temps

Résumé du poste

Un cabinet de recrutement recherche un Chef de Projet Bio Informaticien pour le Collecteur Analyseur de Données situé à Paris. Vous serez intégré à l'équipe Recherche et Innovation et travaillerez sur divers projets innovants en génomique humaine. Les responsabilités incluent l'élaboration de designs expérimentaux, l'identification de données pertinentes, et la mise en oeuvre de la démarche Qualité pour les développements. Une expertise en programmation, développement logiciel, et interaction avec des équipes techniques est exigée.

Qualifications

• Développement de designs expérimentaux pour des comparaisons de logiciels.
• Identification de jeux de données pour le développement.
• Rédaction de rapports bibliographiques et synthèses.
• Animation de la feuille de route des projets Recherche & Innovation.
• Mise en oeuvre de la démarche Qualité Interne.

Responsabilités

• Contribuer à l'amélioration continue des procédures via le prototypage et maintenance des pipelines.
• Identifier les priorités stratégiques et fonctionnelles.

Connaissances

Langages de programmation en génomique (Shell, Python, R)

Développement logiciel

Utilisation d'un cluster de calculs

Versionning avec Git

Capacité d'analyse et de synthèse

Communication avec équipes techniques

Formation

Parcours confirmé en génomique humaine

Description du poste

Hadley Search, cabinet de recrutement dédié aux acteurs du secteur public et aux collectivités, recrute pour le Collecteur Analyseur de Données (CAD), un Chef de Projet Bio Informaticien Maladies Rares F / H.

Le CAD est un Groupement d'Intérêt Public développé dans le cadre du Plan France Médecine Génomique 2025 (PFMG). Créé le30 novembre 2022, le GIP-CAD regroupe les représentants de l'État (MSP et MESR), les Laboratoires de Médecine Génomique SeqOIA et AUTRAGEN, Unicancer, la Conférence des Directeurs Généraux de CHU, le CEA, l'Inria, l'Inserm et France Universités.

Le GIP-CAD a pour but de proposer des services liés à l'activité de soin du PFMG : aide à l'interprétation médicale des examens pangénomiques effectués par les Laboratoires de Médecine Génomique du PFMG, aide à la réanalyse des données et archivage des données de séquençage. Il a également pour objectif de permettre la réutilisation des données de génomique pour la recherche.

Le Plan France Médecine Génomique 2025, initié en 2016, développe les conditions nécessaires à l'accès à tous au diagnostic génétique en France. Il vise 3 objectifs : intégrer la médecine génomique dans le parcours de soins courant et la prise en charge des pathologies, développer une filière nationale de médecine génomique au service des patients capable d'être un levier d'innovation scientifique et technologique et placer la France dans le peloton de tête des grands pays engagés dans la médecine personnalisée.

Intégré à l'équipe Recherche et Innovation en génomique constitutionnelle - maladies rares et rattaché au Directeur du Service Maladies Rares, vous évoluez en binôme avec le référent médical et scientifique et vous êtes également en liens permanents avec la responsable de l'accompagnement des projets de recherche externes au CAD et les projets européens l'impliquant. Vos missions principales sont :

• Élaborer des designs expérimentaux pour des comparaisons de logiciels existants
• Identifier des jeux de données pertinents pour le développement
• Établir des rapports bibliographiques sur les questions scientifiques abordées et des synthèses de résultats et procédures en interne
• Animer et suivre la feuille de route des développements Recherche & Innovation pour la génomique constitutionnelle du CAD
• Identifier les priorités stratégiques et / ou fonctionnelles
• Mettre en oeuvre la démarche Qualité Interne pour le transfert des développements vers la routine de l'infrastructure
• Contribuer à l'amélioration continue des procédures via le prototypage, le paramétrage, l'évolution et la maintenance des pipelines

Issu d'un parcours confirmé en génomique humaine, vous avez développé une réelle expertise des langages de programmation courant en génomique (Shell, Python, R), du développement logiciel et de l'utilisation d'un cluster de calculs (travail avec ordonnanceur de tâches, containérisation, gestionnaire de workflow) et de l'outil de versionning Git. Vous maîtrisez la démarche de certification d'un développement informatique.

Reconnu pour votre capacité à dialoguer avec les métiers et les équipes techniques (internes ou externes) et à adopter un langage commun, vous appréciez travailler dans une logique collaborative au sein d'un environnement innovant en plein développement. Votre esprit d'analyse et de synthèse et votre force de proposition seront déterminants.