Bio-Informaticien Expert H / F

Institut de Cancérologie de l'Ouest; Angers; Sur place; EUR 40 000 - 55 000; Plein temps

Résumé du poste

Un établissement de santé spécialisé en France est à la recherche d'un bioinformaticien pour superviser les workflows d'analyses bioinformatiques et maintenir l'accréditation ISO15189. Le candidat idéal doit avoir un diplôme Bac +5 en bio-informatique avec une double formation en biologie et informatique. Les compétences en Python, R, HTML, et SQL sont essentielles, ainsi qu'une compréhension des normes de qualité. Ce poste offre l'opportunité de travailler sur des projets de pointe dans le domaine de la génétique moléculaire.

Qualifications

• Diplôme d'État de Bio-informaticien requis.
• Connaissance de la norme ISO15189 souhaitée.
• Capacité à former les utilisateurs finaux.

Responsabilités

• Superviser et exécuter les workflows d'analyses bioinformatiques.
• Former les utilisateurs finaux sur les résultats.
• Maintenir l'accréditation ISO15189 pour le NGS.

Connaissances

Bio-informatique

Python

R

HTML

SQL

Unix

Gestion de laboratoire

Formation

Bio-informaticien (Bac +5)

Double formation en Biologie et Informatique

Description du poste

Activites

Bioinformatique

• Mise en place, supervision et exécution des workflows d'analyses bioinformatiques basés sur les technologies de biologie moléculaire et de NGS présentes sur la Plateforme de Génétique Moléculaire.
• Analyse des données de génomique constitutionnelle et somatique produites sur la plateforme de l'ICO : panels ciblés (ADN et ARN), exome (WES), génome (WGS), transcriptome (WTS), signatures mutationnelles, CNV
• Mise en forme des résultats (visualisation des données).
• Formation des utilisateurs finaux.
• Participation aux évolutions techniques et applicatives des workflows mis en place, veille scientifique

Qualite

• Mise en place et maintien de l'accréditation ISO15189 du NGS pour la composante informatique en relation avec le responsable de l'accréditation.
• Participation au système de management de la qualité via l'extraction de données du logiciel de gestion de laboratoire (activité, facturation, délais, non-conformités).

Projets

• Participation aux projets transversaux de la Plateforme de Génétique Moléculaire.

Autres

• Participation à la valorisation scientifique de la Plateforme de Génétique Moléculaire.
• Participation à l'encadrement de stagiaires de la Plateforme de Génétique Moléculaire (M1, M2).
• Diplôme : Bio-informaticien (Bac +5)
• Double formation universitaire souhaitée : Biologie (biologie moléculaire et génomique) et Informatique (langages : Python, R, HTML, SQL ; environnement : Unix)
• Connaissance souhaitée de la norme ISO15189 et de la démarche qualité au sein d'un établissement de santé.