Ingénieur-e détude en Bioinformatique - H/F

Inserm France; Illkirch-Graffenstaden; Sur place; EUR 35 000 - 50 000; Plein temps

Résumé du poste

Un institut de recherche biomédicale recherche un(e) ingénieur(e) en bioinformatique pour rejoindre l'équipe à Strasbourg. Le rôle implique d'analyser des données omiques et de développer des méthodes bioinformatiques pour une recherche sur les mécanismes de maturation neuronale. Les candidats doivent avoir un Bac +5 en biologie computationnelle ou bioinformatique et des compétences en codage. Ce poste est un contrat de 12 mois renouvelable offrant l'opportunité de travailler dans un environnement de recherche dynamique.

Qualifications

• Solides compétences en codage à l'aide de Python, R, et git.
• Expérience en analyse NGS (RNAseq, protéomique, trap-seq).
• Intérêt pour les neurosciences et le développement neurologique.

Responsabilités

• Analyser et interpréter des données omiques à haut débit.
• Développer des méthodes bioinformatiques pour des projets de recherche.
• Collaborer avec l'équipe pour enrichir le projet.

Connaissances

Compétences en codage (Python, R, git)

Analyse biostatistique

Interprétation de données NGS

Solutions de problèmes

Communication interpersonnelle

Formation

Bac +5 en biologie computationelle ou bioinformatique

Outils

Outils de ligne de commande Unix/Linux

Description du poste

L’Institut de génétique et de biologie moléculaire et cellulaire est un des principaux centres de recherche biomédicale en Europe et la plus grosse unité de recherche qui associe l'Inserm, le CNRS et l'Université de Strasbourg. L’IGBMC est composé de 4 départements scientifiques dont les domaines d’investigation sont la biologie du développement et les cellules souches, la biologie structurale intégrative, la génomique fonctionnelle, le cancer, la médecine translationnelle, la neurogénétique. L'IGBMC a également développé des services scientifiques et plateformes technologiques de pointe. Le campus de l'IGBMC est situé sur le Parc d'innovation d'Illkirch dans la banlieue strasbourgeoise, un environnement scientifique académique et industriel exceptionnel qui favorise largement les collaborations et le transfert technologique. https://www.igbmc.fr. L’ingénieur-e sera accueilli-e dans l’équipe ‘Mécanismes physiologiques et pathologiques du développement cortical’ dirigée par Juliette Godin.

Mission principale

Nous recherchons un(e) ingénieur(e) en bioinformatique très motivé(e) et créatif(ve) pour rejoindre l'équipe "‘Mécanismes physiologiques et pathologiques du développement cortical" à l'Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire (IGBMC) à Strasbourg, France. Le candidat retenu fera partie d'une équipe de recherche interdisciplinaire qui se concentre sur l'élucidation des mécanismes fondamentaux qui dictent l'acquisition du destin cellulaire et la maturation neuronale au cours de la corticogenèse chez les mammifères. Il/elle sera impliqué(e) dans un projet financé par l’ANR qui vise à étudier dans quelle mesure la modulation de l'abondance et/ou de la modification des ARN de trasnfert contrôlent la traduction locale. Il/elle développera des méthodes bioinformatiques et statistiques pour analyser, interpréter et intégrer les données omiques à haut débit publiées et nouvellement générées. Il/elle travaillera de manière productive grâce à des interactions collaboratives avec divers membres de l'équipe.

Activités principales

Les principales tâches du candidat seront d'analyser, d'interpréter et d’intégrer des données publiées de RNAseq, protéomique et trap-seq, afin de caractériser l'utilisation/l’optimalité des codons dans des contextes cellulaires ou pathologiques spécifiques.

Profil recherché

Spécificité du poste: Poste à pourvoir dans l’équipe du Dr Juliette Godin

Connaissances

• Solides compétences en codage à l'aide de python, R, git, outils de ligne de commande basés sur Unix/Linux.
• Familiarité avec les principaux algorithmes ou pipelines d'analyse NGS (outils d'alignement, analyse de l'expression différentielle, etc.).
• Connaissances / compétences en analyse biostatistique.
• Expérience préalable en termes d’extraction d'informations biologiques à partir de données NGS et des principales bases de données bioinformatiques.
• Intérêt pour les neurosciences/le développement neurologique.

Aptitudes

• Apprentissage rapide, esprit critique, attitude positive, fortes compétences en matière de résolution de problèmes et adaptabilité à de nouvelles données et questions.
• Excellentes aptitudes aux relations interpersonnelles et au travail en équipe.
• Solides compétences en communication pour présenter des concepts informatiques et expliquer votre travail à un large éventail de publics.
• Excellentes compétences organisationnelles, motivation personnelle et créativité.

Expériences souhaitées

Nous étudierons tous les profils (avec ou sans expériences antérieures), la motivation et l’intérêt pour les thématiques étant des critères de selection majeurs.

Niveau de diplôme

Bac +5: diplôme spécialisé en biologie computationelle, bioinformatique, biostatistique ou domaine connexe.

Durée

12 mois renouvelable.