Ingénieur·e d’études en traitement et analyse d’images et de signaux en neurosciences

France Life Imaging; La Tronche; Sur place; EUR 40 000 - 60 000; Plein temps

Résumé du poste

Un institut de recherche en neurosciences à La Tronche recherche un·e Ingénieur·e d’études pour concevoir et mettre en œuvre des pipelines de traitement de données IRM et EEG. Vous interagirez avec des chercheurs, contribuerez à la formation et assurerez une veille scientifique. Requis : Bac + 3, compétences en développement et maîtrise des outils d'analyse de données.

Qualifications

• Un niveau B1/B2 en langue anglaise est attendu.
• La maîtrise de l'anglais scientifique serait un plus.
• Des compétences en développement seraient souhaitables.

Responsabilités

• Guider les utilisateurs dans la conception de pipelines de traitement de données IRM.
• Contribuer au développement d'outils pour faciliter la gestion d’images IRM.
• Assurer une veille scientifique et technologique.

Connaissances

Maîtriser les outils et logiciels académiques standards (SPM, FSL, FreeSurfer, ANTs, MRTRIx…)

Maîtriser les outils de développement logiciel (Python, Matlab, C/C++, R)

Avoir de l'expérience en traitement de données IRM

Connaître les approches de type intelligence artificielle

Savoir écouter et détecter les besoins des utilisateurs

Formation

Bac + 3

Outils

Python

Matlab

C/C++

R

Description du poste

Overview

Date de l'annonce : mercredi 28 septembre 2022
Intitulé du poste : Ingénieur·e d’études en traitement et analyse d’images et de signaux en neurosciences

Contexte et mission

Missions principales :

• Sous l'encadrement du Responsable du service "analyse et traitement d’images" à IRMaGe, guider les utilisateurs dans la conception puis dans la mise en œuvre de pipelines de traitement de données IRM (priorité 1) et/ou EEG (priorité 2) à l’état de l’art et adaptées aux hypothèses de recherche des projets.
• Contribuer au développement et à la mutualisation d’outils ou pipelines développés par les utilisateurs pour faciliter la gestion et l’analyse d’images IRM et/ou de signaux EEG.
• Participer au contrôle qualité sur les données acquises sur les équipements d’IRMaGe.

Activités principales :

• Définir et paramétrer des « pipelines » de traitement de référence en IRM (notamment IRM fonctionnelle d’activation et de repos, morphométrie IRM, IRM de diffusion et de connectivité, IRM de perfusion, Spectroscopie IRM) et/ou d’analyse de signaux en EEG (localisation de sources, DCM, potentiels évoqués, analyses temps-fréquence, etc.).
• Contribuer à la formation de chercheurs (formation dans les laboratoires, sur la plateforme IRMaGe) et d’étudiants UGA (à travers des interventions en Master 2).
• Assurer une veille scientifique et technologique sur les méthodes d’analyses, les enjeux de recherche et les outils logiciels disponibles, utiles à la plate-forme et à ses utilisateurs.
• Intégrer certains « pipelines » de traitement identifiés dans un environnement permettant l’intégration multi-logiciels et en rendant l’usage abordable par d’autres utilisateurs.
• S'impliquer scientifiquement dans l’analyse des données en fonction des demandes des utilisateurs.
• Participer à des tâches d’intérêt collectif sur la plateforme IRMaGe.
• Des déplacements dans les laboratoires utilisateurs et pour des conférences/formations sont à prévoir. Des déplacements occasionnels à l'étranger sont à envisager.

Lieu

UMS IRMaGe, Pavillon Taillefer, Rond point de la chantourne, 38700 La Tronche

Rémunération

A partir de 1891€ mensuel brut et en fonction de l’expérience. Vous percevrez en plus de votre salaire un régime indemnitaire d'un montant mensuel brut de 279 €.

Diplômes requis

Bac + 3 / Un niveau B1/B2 en langue anglaise est attendu. La maîtrise de l'anglais scientifique serait un plus. Des compétences en développement seraient souhaitables. Une formation dans l'un des domaines suivants serait appréciée : mathématiques appliquées, informatique scientifique, modélisation, simulation numérique, calcul intensif, ingénierie biomédicale, neurosciences.

Compétences requises

Maîtriser les outils et logiciels académiques standards (SPM, FSL, FreeSurfer, ANTs, MRTRIx…); Maîtriser les outils de développement logiciel (Python, Matlab, C/C++, R; environnements Eclipse, Visual Studio, cmake, Xcode; systèmes de suivi de versions). Avoir de l'expérience en traitement de données IRM de l’acquisition à l’interprétation ainsi qu’en traitement de données EEG. Connaître les approches de type "intelligence artificielle" pour le traitement de données (segmentation ou classification). Avoir de l'expérience en déploiement de pipelines de traitement sur des grilles de calcul pour données massives. Savoir écouter et détecter les besoins des utilisateurs; assurer une veille scientifique et technologique; savoir documenter ses travaux. Être autonome, organisé·e et rigoureux/se; savoir travailler en équipe; manifester de la curiosité.

Contact

Sur le recrutement : Sally OMBE, [e-mail]
Sur le poste : Emmanuel BARBIER, [e-mail]
Eric CONDAMINE, [e-mail]