PhD student (m / f / d)

Robert-Bosch-Krankenhaus GmbH; Korntal-Münchingen; Vor Ort; EUR 40.000 - 60.000; Vollzeit

Zusammenfassung

Eine renommierte Forschungseinrichtung in Korntal-Münchingen sucht einen Doktoranden (m/w/d) im Bereich Bioinformatik. Sie werden an innovativen Projekten zur Krebsforschung arbeiten und Multi-Omics-Daten analysieren. Ein Masterabschluss in Bioinformatik sowie starke analytische und Programmierfähigkeiten sind erforderlich. Wir bieten ein unterstützendes Team und modernste Technologien zur Durchführung Ihrer Forschung.

Leistungen

Interaktive Teamarbeit

Moderne Technologien

Qualifikationen

• Erfahrung in der Analyse von Bulk- und Einzelzell-RNA-Sequenzierungsdaten.
• Interesse an Onkologie und personalisierter Medizin.
• Gute Kenntnisse in Biostatistik wären vorteilhaft.

Aufgaben

• Bioinformatische Analyse von Multi-Omics-Daten.
• Charakterisierung von Primärtumoren und Metastasen.
• Durchführung von Analysen mit biostatistischen Methoden.

Kenntnisse

Erfahrung in der Analyse von RNA-Sequenzierungsdaten

Starke Programmierkenntnisse in R

Gute Englischkenntnisse

Ausbildung

Masterabschluss in Bioinformatik oder verwandtem Bereich

Tools

R

Python

Jobbeschreibung

Overview

PhD student (m / f / d)

Full-time

Field

Tätigkeitsfeld : Wissenschaft und Forschung

Company Description

The Dr. Margarete Fischer-Bosch Institute of Clinical Pharmacology, Stuttgart (Director Prof. Dr. M. Schwab) is operated by the Robert Bosch Foundation. Since its foundation in 1973, the institute has emerged as Germany's largest and most renowned scientific research unit in the field of clinical pharmacology. Main research activities concentrate on the influence of genetic and non-genetic factors on variability of drug efficacy and their contributions to disease development.

The PhD project focuses on “Non-canonical G protein signaling : Mechanism, Functions, Consequences” and will address various aspects of cancer therapy and tumor cell biology through -omics data analysis. The project will be closely linked to clinical aspects of cancer research.

Job Description

• Bioinformatic analysis of multi-omics data to elucidate the role of nucleoside diphosphate kinases (NDPK) in the tumor microenvironment and their potential influence on cancer progression and metastasis
• Characterization of primary tumors and metastasis using multi-omics data sets (e.g. genomics, metabolomics) with focus on single-cell and spatial transcriptomics RNA sequencing data
• Integrated analysis of clinical phenotypes and -omics data using biostatistics and bioinformatics
• Application of a broad spectrum of established and new bioinformatics analysis strategies with focus on single-cell and spatial transcriptomics RNA seq and data integration
• Capacity and enthusiasm to undertake the training activities of a graduate program supported by programs of the Faculty of Medicine and the Graduate Academy of the University of Tuebingen to ensure greatest possible success in your career track

Qualifications

• Master degree (M.Sc.) in bioinformatics, applied bioinformatics or a related discipline
• Experience and strong background in the analysis of bulk and single-cell RNA sequencing data and data interpretation
• Experience in the analysis of multi-omics datasets (e.g. proteomics, transcriptomics, genomics)
• Strong programming skills in R, and preferably in Python
• Solid background in cancer biology
• Good knowledge in biostatistics would be beneficial
• Interest in oncology and personalized medicine
• Excellent English written and oral communication skills

Additional Information

We offer :

• The opportunity to work in an interactive team providing support and mentoring
• State-of-the-art equipment and technologies for a wide range of different applications (genomics, transcriptomics, metabolomics) and expert knowledge within the different core facilities (e.g. core facility “Biostatistics / Bioinformatics, Pharmacometrics and Digital Science”) at the institute

Participation in the PhD program

• The opportunity to communicate scientific results at international conferences and to participate in workshops
• A unique feature of the educational program is the co-supervision of each PhD student by a team of investigators, which contribute with their unique expertise to the progress of the projects
• An initial contract for 3 years and flexible starting date (earliest starting date as of now)

Contact

Prof. Dr. Matthias Schwab

0711-8101-3700

Dr. Elke Schaeffeler

0711-8101-3729

Application

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