Ingénieur-e biologiste en traitement et analyse de données massives issues des technologies de [...]

CNRS; Nantes; Sur place; EUR 40 000 - 60 000; Plein temps

Résumé du poste

Une institution de recherche scientifique à Nantes recherche un ingénieur-e biologiste en traitement et analyse de données massives liées aux technologies de séquençage à haut débit. Le candidat idéal doit posséder une connaissance approfondie des protocoles et de l'analyse de données. Les responsabilités incluent la mise en place de procédures et la diffusion des résultats. Ce poste offre l'opportunité de contribuer à des projets de recherche innovants en bioinformatique et en biostatistiques.

Qualifications

• Connaissance générale en biologie.
• Connaissance approfondie des protocoles de données omics et NGS.
• Compétences en recueil et traitement des données.

Responsabilités

• Mettre en place les procédures de recueil de données massives.
• Réaliser le traitement des données massives.
• Diffuser des résultats sous forme de rapports techniques.

Connaissances

Biologie

Protocoles expérimentaux

Analyse de données

Description du poste

Ingénieur-e biologiste en traitement et analyse de données massives issues des technologies de séquençage à haut débit (NGS). H/F

Date Limite Candidature : jeudi 15 janvier 2026 17:00:00 heure de Paris

Informations générales

• Réservé uniquement aux agents CNRS (fonctionnaires et CDI)
• Intitulé de l'offre : Ingénieur-e biologiste en traitement et analyse de données massives issues des technologies de séquençage à haut débit (NGS). H/F
• Référence : UMR6286-MOBINT-K53032
• Lieu de travail : NANTES
• Institut : INSB - Institut des sciences biologiques
• Date de publication : mercredi 3 décembre 2025
• Session : Campagne Hiver 2026
• Groupe de Fonction : IEG3
• BAP : A - Sciences du vivant, de la terre et de l'environnement
• Emploi type : Ingenieure ou ingenieur biologiste en traitement de donnees

Missions

L'ingénieur en bioinformatique et biostatistiques (spécialité « omics ») recueille, traite et analyse des données massives issues de technologies omics et NGS (Chip-Seq, Methylome, RNA seq, métagénomique, méta-transcriptomique, intégration de données), sur des modèles biologiques différents (microalgues et bactéries), champignons, bactéries ...

Activités

Activités principales

• Mettre en place et optimiser les procédures de recueil et de contrôle des données massives issues de technologies omics et NGS
• Réaliser le traitement des données massives
• Diffuser et valoriser des résultats sous forme de rapports techniques ou d'études et d'interfaces web
• Organiser la mise en forme, le stockage des données
• Assurer la maintenance des bases de données créées
• Adapter les applications informatiques aux besoins du projet
• Conseiller et former aux techniques et outils développés
• Définir les procédures d'assurance qualité et veiller à leur mise en œuvre
• Assurer une veille scientifique et technologique dans son domaine d'activité

Activité spécifique ou transverse

• Gérer et maintenir des équipements et outils informatiques partagés

Compétences

Savoirs / connaissances

• Biologie (connaissance générale)
• Protocoles expérimentaux (connaissance approfondie) permettant de générer des données massives issues de technologies omics et NGS (ex RNA seq, génomique, métagénomique et méta-transcriptomique, illumina et PAC bio, Nanopore, Chip seq, méthylomes...)
• Recueil, analyse et traitement des données (connaissance approfondie)

Savoir-faire

• Traiter des données
• Interagir avec des biologistes et des informaticiens
• Garantir la qualité et la pertinence des outils d'analyse et des résultats
• Transmettre des connaissances
• Utiliser les techniques de présentation

Savoirs-être

• Sens de l'organisation
• Sens critique
• Travail en équipe

Contexte de travail

La personne recrutée effectuera ses missions de recherche en soutien à l'équipe « Epigénomique des Microalgues et Interactions avec l'Environnement » dont les activités génératrices de données massives sont en très forte croissance. Elle travaillera en réseau avec d'autres personnels de l'unité pour la gestion des équipements et outils informatiques. Elle sera sous la responsabilité hiérarchique du responsable de l'équipe de recherche.