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Statisticien / Computational Scientist f/h

RAGT

Caufour

Sur place

EUR 40 000 - 55 000

Plein temps

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Résumé du poste

Une entreprise de sélection végétale recherche un expert en génétique statistique pour développer des méthodologies innovantes intégrant des données multi-omiques. Ce poste implique la conception de modèles avancés et l'optimisation de calculs en utilisant des infrastructures HPC. Les candidats doivent avoir un niveau Master ou Doctorat en statistiques et une solide expérience en modélisation et bioinformatique. Un environnement de travail collaboratif vous attend en Occitanie.

Qualifications

  • Expérience dans la modélisation statistique et l'apprentissage automatique.
  • Compétences en bioinformatique et gestion de données.
  • Capacité à travailler en équipe interdisciplinaire.

Responsabilités

  • Développer de nouvelles méthodologies pour l'amélioration variétale.
  • Concevoir des modèles combinant des approches statistiques avancées.
  • Optimiser les calculs à grande échelle en utilisant des infrastructures HPC.

Connaissances

Modélisation statistique
Apprentissage automatique
Bioinformatique

Formation

Master ou Doctorat en statistiques, biostatistiques ou domaine connexe

Outils

Outils HPC
Langages de programmation (Python, R)
Description du poste

RAGT 2n, filiale recherche de RAGT Semences, compte plus de 300 collaborateurs et est l'un des leaders européens de la sélection végétale avec environ 200 nouvelles variétés de grandes cultures inscrites chaque année dans l'Union européenne pour 26 espèces, couvrant les besoins de 85 % de la superficie agricole européenne.

RAGT soutient le progrès génétique pour une agriculture plus durable et plus respectueuse de l'environnement. Notre mission principale est d'offrir aux agriculteurs de nouvelles variétés innovantes de cultures de plein champ, intégrant les dernières avancées biotechnologiques. Notre ambition est de créer des variétés hautement performantes, intégrant les exigences sociétales d'une utilisation contrôlée des intrants et relevant des défis importants tels que le changement climatique et les nouveaux agents pathogènes.

Vos missions :

Au sein de l'équipe de génétique statistique, vous participez au développement de nouvelles méthodologies et de nouveaux outils pour l'amélioration variétale. Vous concevez et mettez en œuvre des approches statistiques et informatiques avancées qui intègrent des données génomiques, phénomiques et enviromiques afin d'accélérer la prise de décision dans les programmes de sélections. Ce rôle est essentiel à la mise en place de méthodes innovantes pour l'accélération du gains génétiques :

  • Concevoir et piloter le développement de modèles intégratifs combinant génétique quantitative et données multi-omiques
  • Développement de modèles sophistiqués combinant des approches statistiques classiques, bayésiennes et d'apprentissage automatique afin d'améliorer la prédiction des performances des variétés
  • Optimisation des calculs à grande échelle grâce à des stratégies adaptées aux infrastructures HPC ou cloud (parallélisation, algèbre linéaire optimisée, etc.)
  • Construction de pipelines d'analyse reproductibles et évolutifs en collaboration avec les généticiens quantitatifs, scientifiques, bioinformaticiens et les sélectionneurs des diverses espèces représentées
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