Post-doctorant (H/F) – Génétique quantitative et génomique de populations d'albatros

CNRS; Villiers-en-Bois; Sur place; EUR 40 000 - 60 000; Plein temps

Résumé du poste

Un institut de recherche renommé en Nouvelle-Aquitaine recherche un post-doctorant en génétique quantitative et génomique. Le candidat sera impliqué dans des projets sur les albatros et travaillera sur des analyses de données RAD-seq. Des compétences en modélisation statistique et bioinformatique sont requises. Le poste est basé à Villiers-en-Bois avec possibilité de télétravail. La durée du contrat est de 24 mois avec un salaire compétitif.

Qualifications

• Expérience de 1 à 4 années en recherches similaires.
• Compétences en gestion et analyse de données.
• Indépendance et sérieux scientifique.

Responsabilités

• Analyser des données RAD-seq et combiner avec des jeux de données existants.
• Estimer l'évolution, l'héritabilité et les corrélations génétiques.
• Contribuer à des modèles de projection démographique.

Connaissances

Connaissances en génétique quantitative et génomique

Modélisation statistique avancée

Bioinformatique

Communication scientifique

Anglais professionnel

Formation

Doctorat

Outils

R

Description du poste

Post-doctorant (H/F) – Génétique quantitative et génomique de populations d'albatros

Cette offre est disponible dans les langues suivantes :

Date Limite Candidature : jeudi 1 janvier 2026 00:00:00 heure de Paris

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Informations générales

Intitulé de l'offre : Post-doctorant (H/F) – Génétique quantitative et génomique de populations d'albatros

Référence : UMR7372-TIMBON-003

Nombre de Postes : 1

Lieu de travail : VILLIERS EN BOIS

Date de publication : vendredi 24 octobre 2025

Type de contrat : Chercheur en contrat CDD

Durée du contrat : 24 mois

Date d'embauche prévue : 1 avril 2026

Quotité de travail : Complet

Rémunération : salaire brut entre 2 991 € et 4166 (en fonction de l'expérience)

Niveau d'études souhaité : Doctorat

Expérience souhaitée : 1 à 4 années

Section(s) CN : 29 - Biodiversité, évolution et adaptations biologiques : des macromolécules aux communautés

Missions

Le projet ANR «DWELLS» cherche à comprendre l’importance des changements génétiques à court terme pour la démographie des oiseaux marins longévifs. Le projet se base sur des suivis de trois populations d'albatros, individus centrés à long-terme menés dans les territoires subantarctiques français. Les pédigrées constitués permettent d'estimer certains paramètres de génétique quantitative, mais ils sont lacunaires et contiennent des erreurs, ce qui limite grandement les capacités du jeu de données malgré des tailles d'échantillon substantielles. Pour pallier ce problème, nous utilisons du séquençage RAD-seq individuel pour estimer directement l'apparentement entre individus et corriger les pédigrées.

La première mission du post-doctorat est donc de traiter les données RAD-seq et les combiner avec le jeu de données existant. La/le post-doctorant.e devra ensuite exploiter ce jeu de donnée combiné pour estimer l'évolution récente, l'héritabilité, les corrélations génétiques, et l'évolvabilité de traits, voire la dépression de consanguinité. Du travail sur la modélisation de la sélection est en cours, et la/le post-doctorant.e pourra également y contribuer. Selon l'avancement du projet dans son ensemble, ces résultats pourront être inclus dans des modèles de projection démographique sous des scénarios de changement environnementaux.

Les données RAD-seq pourront être complétées pour quelques individus par des données de génomes complets séquencés en faible profondeur. Ces données pourraient permettre d'affiner l'étude de la consanguinité, d'estimer les tailles de population efficaces passées, et potentiellement de tester une réponse évolutive à l'épizootie d'influenza aviaire actuelle.

Tous ces travaux devront être valorisés dans des publications scientifiques et des présentations en conférence.

Activités

• Traitements bioinformatiques
• Analyses de données
• Modélisation statistiques et mathématique de l'évolution de traits quantitatifs (et de la démographie)
• Publication des résultats dans des revues à comité de lecture et participation à des conférences
• Aide à l'encadrement des étudiants et à l'animation scientifique du laboratoire

Compétences

• Connaissances en génétique quantitative, génomique ou biologie évolutive indispensables, connaissances supplémentaires en écologie, démographie, oiseaux marins appréciées.
• Modélisation statistique avancée (GLMMs, modèles à représentation d'état, programmation Bayésienne stochastique) sous R
• Expérience avec de la bioinformatique, si possible expérience dans l'utilisation de données RAD-seq et/ou lcWGS (sinon, compétence à développer)
• Gestion et analyse de données, notamment issues de suivis individus-centrés à long-terme
• Communication scientifique, publication dans des revues à comité de lecture et présentation en conférence
• Anglais à un niveau professionnel
• Indépendance et sérieux scientifique

Contexte de travail

Le poste sera localisé au Centre d’Études Biologiques de Chizé, UMR 7372 CNRS-La Rochelle Université. Le CEBC est un laboratoire d'écologie s'appuyant sur de nombreux suivis à long terme visant à étudier sur la réponse des êtres vivants aux perturbations de l’environnement (changements climatiques, pratiques agricoles, contaminations environnementales...). Des séjours auprès de collaborateurs dans d'autres centres de recherche sont envisagés afin d'opérer des transferts de compétences. Des périodes de télétravail sont envisageables. Le projet est financé par une bourse ANR qui s'achève fin décembre 2028 (le poste devra donc absolument être fini à cette date).

Contraintes et risques

Néant