Ingénieur Bio-Informatique NGS & Workflow

CHU DE MONTPELLIER; Montpellier; Sur place; EUR 40 000 - 60 000; Plein temps

Résumé du poste

CHU de Montpellier recrute un ingénieur en bio-informatique et informatique pour soutenir la plateforme BIO2M. Vous déployez les logiciels d’analyse pour le traitement des données de séquençage haut débit, assurez les mises à jour et développez des procédures automatisées avec Snakemake et les outils OMICS.

Vous codifiez, gérez les données et participez aux formations. Vous serez en contact avec les demandeurs pour concevoir l’étude et rendre les résultats, en créant des index et en maintenant

Qualifications

• Maîtrise de l’analyse NGS et bio-informatique appliquée.
• Expérience en indexation et en programmation de pipelines.
• Compétences en développement web et en gestion de projets informatiques.

Responsabilités

• Gérer les données et former les utilisateurs.
• Collaborer avec les demandeurs pour concevoir les études et rendre les résultats.
• Créer des index à partir de cohorts RNAseq/Omics.
• Utiliser et concevoir des gestionnaires de workflow.
• Maintenir et améliorer le site TranSipedia.

Connaissances

Bioinformatique NGS

Indexation de données

Programmation Python

Web développement

Communication avec demandeurs

Formation

Master 2 bio-informatique

Outils

Reindeer

Gestionnaire de workflow

Description du poste

CHU de Montpellier recrute un ingénieur en bio-informatique et informatique pour soutenir la plateforme BIO2M. Vous déployez les logiciels d’analyse pour le traitement des données de séquençage haut débit, assurez les mises à jour et développez des procédures automatisées avec Snakemake et les outils OMICS.

Vous codifiez, gérez les données et participez aux formations. Vous serez en contact avec les demandeurs pour concevoir l’étude et rendre les résultats, en créant des index et en maintenant