Responsable Pôle Analyse des Données et Séquençage

La Gazette des Communes; Paris; Sur place; EUR 42 000 - 65 000; Plein temps

Résumé du poste

Université Paris Cité recherche un ingénieur d'études bioinformaticien pour superviser l’analyse des données de séquençage et coordonner une équipe. Vous piloterez les pipelines, assurerez qualité et traçabilité, et soutiendrez les projets translationnels en collaboration avec les chercheurs et les plateformes technologiques.

Le rôle nécessite une expertise en génomique, pipeline NGS et gestion de données; travail en équipe et sens de l’organisation sont essentiels dans ce poste basé à Paris.

Qualifications

• Maîtrise des outils d’analyse génomique et transcriptomique.
• Connaissance des formats FASTQ, BAM/CRAM, VCF et HPC.
• Anglais scientifique et travail en équipe.

Responsabilités

• Organiser et coordonner les activités d’analyse des données de séquençage de la plateforme.
• Superviser la production bioinformatique et garantir la qualité des résultats.
• Développer et faire évoluer les pipelines et outils d’analyse de données génomiques.
• Assurer la gestion des données et le suivi des projets de séquençage.
• Apporter une expertise méthodologique aux chercheurs pour l’analyse et l’interprétation des données.
• Encadrer hiérarchiquement et fonctionnellement une équipe de 5 ingénieurs bioinformaticiens.
• Participer à la formation des utilisateurs et à la diffusion des bonnes pratiques.
• Contribuer aux projets scientifiques et à l’évolution technologique de la plateforme.
• Participer à des réunions, formations et groupes de travail.

Connaissances

Génomique

NGS

Linux/Unix

Bash scripting

Python

Formation

Niveau II - Bac+3 Licence

Outils

Pipelines d’analyse NGS

Bases de données (PostgreSQL/MySQL)

Description du poste

Université Paris Cité recherche un ingénieur d'études bioinformaticien pour superviser l’analyse des données de séquençage et coordonner une équipe. Vous piloterez les pipelines, assurerez qualité et traçabilité, et soutiendrez les projets translationnels en collaboration avec les chercheurs et les plateformes technologiques.

Le rôle nécessite une expertise en génomique, pipeline NGS et gestion de données; travail en équipe et sens de l’organisation sont essentiels dans ce poste basé à Paris.