Ingénieur d'Études Bio-Informatique — NGS & Pipelines Omics

LesJeudis

Paris

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EUR 42 000 - 62 000

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Résumé du poste

L'École Pratique des Hautes Études (EPHE) recrute pour l'unité ISYEB à Paris un responsable bio-informatique. Vous gèrerez et traitez des données omics issues de projets NGS et développerez des pipelines bio-informatiques.

Vous coopérerez avec les chercheurs, présenterez les résultats et contribuerez à la rédaction d'articles en anglais, tout en assurant la sauvegarde sécurisée des données sur les serveurs EPHE-PSL.

Qualifications

  • Master 2 ou équivalent en bio-informatique ou domaines similaires.
  • Expérience en analyse de données omics et NGS.
  • Connaissance de Linux/Unix.
  • Maîtrise d’au moins un langage de programmation (R/Python/Perl/Julia).
  • Connaissance de la syntaxe shell (bash/zsh).
  • Connaissance de logiciels NGS (BWA/SAMtools/GATK/PICARD/ANGSD/Hifiasm).
  • Bonnes pratiques FAIR et gestion des données.
  • Anglais lu et écrit.

Responsabilités

  • Gérer et traiter les données omics et pipelines NGS.
  • Utiliser et développer des pipelines bio-informatiques.
  • Travailler sur un cluster informatique et gérer de gros jeux de données.
  • Interpréter les résultats et rédiger des parties en anglais.
  • Co-signer des articles et coordonner sauvegarde des données omics.

Connaissances

omics data analysis
NGS basics
Linux/Unix
R/Python/Perl/Julia
Shell scripting
NGS tools
FAIR data
English (read/write)

Formation

Master 2 ou équivalent en bio-informatique / mathématiques appliquées / sciences du vivant

Outils

BWA
SAMtools
GATK
PICARD
ANGSD
Hifiasm

Description du poste

L'École Pratique des Hautes Études (EPHE) recrute pour l'unité ISYEB à Paris un responsable bio-informatique. Vous gèrerez et traitez des données omics issues de projets NGS et développerez des pipelines bio-informatiques.

Vous coopérerez avec les chercheurs, présenterez les résultats et contribuerez à la rédaction d'articles en anglais, tout en assurant la sauvegarde sécurisée des données sur les serveurs EPHE-PSL.

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