Bioinformaticien Clinique – NGS & Diagnostics Expert

SFBI; Paris; Sur place; EUR 52 000 - 76 000; Plein temps

Résumé du poste

Institut Curie recherche un Ingénieur(e) Bioinformaticien CDD de 6 mois (avec extension possible) pour l’unité de Bioinformatique Clinique (BIC) à Paris. Vous travaillerez sur des pipelines d’analyse, l’implémentation d’outils et l’appui à des essais cliniques, avec interaction étroite avec les biologistes et cliniciens.

Le poste requiert maîtrise de Linux, Python/Java/R et connaissances en ML/DL, ainsi que des outils bioinformatiques et une expérience en dénénances NGS.

Qualifications

• Doctorat ou diplôme d’ingénieur en bioinformatique requis.
• Première expérience en analyses de dénénances NGS souhaitée.
• Maîtriser Linux et au moins un langage (Python, Java ou équivalent).
• Connaissance de R et outils bioinformatiques standards pour Dénénches NGS.

Responsabilités

• Réécriture/optimisation de pipelines d’analyses avec conteneurs et tests unitaires.
• Conception et évaluation d’outils pour le diagnostic clinique.
• Participation à des projets de recherche associés à des essais cliniques.
• Présentation régulière des avancées aux collaborateurs (IC).
• Contribution à publications liées aux analyses et aux nouvelles approches.

Connaissances

Linux

Python

Java

R

Machine learning

Deep learning

Autonomie

Esprit d'équipe

Formation

Doctorat ou Diplôme d’Ingénieur en Bioinformatique

Outils

Nextflow/Snakemake

Docker/Singularity

Git

SGB/SLURM/LSF/MOAB

Description du poste

Institut Curie recherche un Ingénieur(e) Bioinformaticien CDD de 6 mois (avec extension possible) pour l’unité de Bioinformatique Clinique (BIC) à Paris. Vous travaillerez sur des pipelines d’analyse, l’implémentation d’outils et l’appui à des essais cliniques, avec interaction étroite avec les biologistes et cliniciens.

Le poste requiert maîtrise de Linux, Python/Java/R et connaissances en ML/DL, ainsi que des outils bioinformatiques et une expérience en dénénances NGS.