Ingénieur Bio-Informatique – Analyse Omics & Workflow

CHU DE MONTPELLIER; Montpellier; Sur place; EUR 27 000 - 33 000; Plein temps

Résumé du poste

CHU DE MONTPELLIER recherche un ingénieur informaticien/bio-informaticien expérimenté pour rejoindre la plateforme BIO2M et piloter les analyses des données de séquençage haut débit. Vous assurerez la mise à jour des logiciels et développements automatisant les procédures avec Snakemake, ainsi que la gestion des données et les formations utilisateurs.

Les activités spécifiques incluent la création d'index à partir de cohortes RNAseq/Omics, l'utilisation et la conception d'un gestionnaire de

Qualifications

• Expérience minimale de 12 mois exigée.
• CDD de 4 mois à Montpellier.
• Compétences en analyse de données et bio-informatique.
• Concevoir et utiliser des workflows.

Responsabilités

• Créer des index à partir de cohortes RNAseq ou Omics.
• Utiliser et concevoir un gestionnaire de workflow.
• Maintenir et améliorer le site TranSipedia.
• Gérer les données et former les utilisateurs.

Connaissances

Analyse de données

Bio-informatique

Programmation informatique

Gestion de données

RNA-seq

Omics

Outils

Snakemake

Gestionnaire de workflow

Description du poste

CHU DE MONTPELLIER recherche un ingénieur informaticien/bio-informaticien expérimenté pour rejoindre la plateforme BIO2M et piloter les analyses des données de séquençage haut débit. Vous assurerez la mise à jour des logiciels et développements automatisant les procédures avec Snakemake, ainsi que la gestion des données et les formations utilisateurs.

Les activités spécifiques incluent la création d'index à partir de cohortes RNAseq/Omics, l'utilisation et la conception d'un gestionnaire de