INGENIEUR BIO-INFORMATIQUE/INFORMATIQUE (H/F)

CHU DE MONTPELLIER; Montpellier; Sur place; EUR 27 000 - 33 000; Plein temps

Résumé du poste

CHU DE MONTPELLIER recherche un ingénieur informaticien/bio-informaticien expérimenté pour rejoindre la plateforme BIO2M et piloter les analyses des données de séquençage haut débit. Vous assurerez la mise à jour des logiciels et développements automatisant les procédures avec Snakemake, ainsi que la gestion des données et les formations utilisateurs.

Les activités spécifiques incluent la création d'index à partir de cohortes RNAseq/Omics, l'utilisation et la conception d'un gestionnaire de

Qualifications

• Expérience minimale de 12 mois exigée.
• CDD de 4 mois à Montpellier.
• Compétences en analyse de données et bio-informatique.
• Concevoir et utiliser des workflows.

Responsabilités

• Créer des index à partir de cohortes RNAseq ou Omics.
• Utiliser et concevoir un gestionnaire de workflow.
• Maintenir et améliorer le site TranSipedia.
• Gérer les données et former les utilisateurs.

Connaissances

Analyse de données

Bio-informatique

Programmation informatique

Gestion de données

RNA-seq

Omics

Outils

Snakemake

Gestionnaire de workflow

Description du poste

ACTIVITES PRINCIPALESL'ingénieur(e) participera à l'organisation de la plateforme BIO2M. Il mettra en place les logiciels d'analyse pour le traitement des données de séquençage haut débit, assurera leur mise à jour et les développements informatiques pour automatiser les procédures avec le logiciel de gestion (Snakemake) et les logiciels de conception d'INDEX de données à grande échelle. Nous recrutons un ingénieur informaticien/bio-informaticien expérimenté pour les taches désignées.- La personne sera également en charge de la gestion des données et participera aux formations qui seront développées pour les utilisateurs- La personne sera en contact avec les demandeurs de prestations pour la conception de l'étude et le rendu de résultatsACTIVITES SPECIFIQUES LIEES AU POSTELes activités spécifiques liées au poste sont :- la création d'index à partir de cohortes (données RNAseq ou Omics) fournies par les demandeurs d'un projet.- L'utilisation et la conception de gestionnaire de workflow- Le maintien et l'amélioration du site Web (TranSipedia)

Type de contrat CDD - 4 Mois
Contrat travail Durée du travail 37H30/semaineTravail en journée
Salaire

• 0000

Profil souhaité

Expérience

• 12 Mois Cette expérience est indispensable

Compétences

• Analyse de données expérimentales
• Analyser des résultats d'exploitation bio-informatiques
• Collecter et analyser des données, des informations
• Langages de programmation informatique

Savoir-être professionnels

• Faire preuve de curiosité, d'ouverture d'esprit
• Faire preuve de rigueur et de précision
• Faire preuve d'autonomie

Informations complémentaires

• Qualification : Employé qualifié
• Secteur d'activité : Activités hospitalières

Employeur

10 000 salariés et plus

Situé au Nord de Montpellier le CHU est classé parmi les meilleurs établissements de santé au niveau national, pour la qualité de la médecine, de la recherche et de son management. C'est plus de 10800 personnes qui travaillent au service de la santé, de la recherche et de la prévention. Le CHU est composé de 12 pôles d'activités qui regroupent des unités cliniques, médico-techniques et pharmaceutiques.

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