Ingénieur d'Études – Analyse NGS et Réséquençage

La Gazette des Communes; Paris; Sur place; EUR 42 000 - 60 000; Plein temps

Résumé du poste

Université Paris Cité recherche un Ingénieur d’études dédié à l’analyse des données de séquençage au sein de la SFR Necker et l’institut Imagine. Vous contribuerez à l’opérationnalisation des pipelines et à l’amélioration continue des méthodes d’analyse bioinformatique.

Le poste exige une maîtrise des environnements Linux/Unix, des outils comme Nextflow/Snakemake et une expérience en données NGS (RNA-seq, panels, exomes, génomes). Travail en équipe dans un cadre fédératif à Paris.

Qualifications

• Maîtrise des environnements Linux/Unix.
• Connaissance des langages de script (Bash, Python ou équivalent).
• Expérience en analyse de données NGS (RNA-seq, exomes, genoms).
• Bonnes pratiques de développement logiciel et reproductibilité des analyses.

Responsabilités

• Gérer les données en provenance des plateformes de séquençage.
• Veiller à la qualité, la reproductibilité et la traçabilité des analyses.
• Assurer le lien avec la plateforme génomique et les partenaires.
• Participer à l’évolution des méthodes, outils et infrastructures dédiés à l’analyse bioinformatique.

Connaissances

Linux/Unix

Python

Shell scripting

NGS data analysis

Bioinformatique

Formation

Niveau II - Bac+3 Licence, Licence professionnelle

Outils

Nextflow

Snakemake

MySQL

PostgreSQL

Git

Description du poste

Université Paris Cité recherche un Ingénieur d’études dédié à l’analyse des données de séquençage au sein de la SFR Necker et l’institut Imagine. Vous contribuerez à l’opérationnalisation des pipelines et à l’amélioration continue des méthodes d’analyse bioinformatique.

Le poste exige une maîtrise des environnements Linux/Unix, des outils comme Nextflow/Snakemake et une expérience en données NGS (RNA-seq, panels, exomes, génomes). Travail en équipe dans un cadre fédératif à Paris.