Ingénieur Bio-Informatique – Responsable Technique

Chu-Dupuytren-1; Limoges; Sur place; EUR 29 000 - 39 000; Plein temps

Résumé du poste

Le CHU de Limoges recherche un ingénieur bio-informaticien pour développer et intégrer des outils et pipelines bio-informatiques, avec une forte implication dans la qualification et la traçabilité des données biologiques. Vous travaillerez en interface avec biologistes, cliniciens et services informatiques dans un cadre diagnostique et de recherche.

Formation Bac +5 en bio-informatique et maîtrise des environnements Linux, Python et gestion des pipelines (Nextflow/Snakemake) exigées.

Qualifications

• Bac +5 en Bio-informatique (École d’ingénieur, Master ou équivalent).
• Maîtrise des principes de bio-informatique appliquée à la biologie médicale.
• Maîtrise des environnements Linux et des outils en ligne de commande.
• Connaissance des workflows et des outils de gestion de versions.

Responsabilités

• Développement et intégration d’outils bio-informatiques, de pipelines et d’interfaces.
• Analyse et interprétation de données biologiques issues du séquençage haut débit.
• Gestion des données biologiques: structuration, archivage et traçabilité.
• Qualification, documentation qualité et participation à l’accréditation.

Connaissances

Bio-informatique

Programmation

Analyse de données

Communication scientifique

Formation

Bac +5 Bio-informatique

Outils

Linux

Python

Bash

Git

GitLab

Nextflow

Snakemake

Docker

Singularity/Apptainer

Description du poste

Le CHU de Limoges recherche un ingénieur bio-informaticien pour développer et intégrer des outils et pipelines bio-informatiques, avec une forte implication dans la qualification et la traçabilité des données biologiques. Vous travaillerez en interface avec biologistes, cliniciens et services informatiques dans un cadre diagnostique et de recherche.

Formation Bac +5 en bio-informatique et maîtrise des environnements Linux, Python et gestion des pipelines (Nextflow/Snakemake) exigées.