Ingénieur Bioinformatique – Analyse RNA-seq & Transcritomes

Cnrs; Paris; Sur place; EUR 32 000 - 42 000; Plein temps

Résumé du poste

CNRS à Paris, au sein du Laboratoire Développement, Adaptation et Vieillissement (IBPS), recrute pour un poste de chercheur/doctorant post-doctoral travaillant sur les perturbations post-transcriptionnelles liées à des mutations de l’hélicase DDX6. Vous analyserez des jeux RNA-seq et développerez des pipelines adaptés, en collaboration avec l’équipe mRNP et condensats.

Le candidat exercera son activité dans un cadre ANR, avec des modèles cellulaires humains et une interface étroite avec les

Qualifications

• Maîtrise des outils RNAseq: alignement, quantification, analyse différentielle, visualisation
• Maîtrise des outils d’analyse des isoformes d’ARN
• Expérience en analyse de transcriptome dans des modèles mammifères
• Rigueur, autonomie, dynamisme, esprit d’initiative

Responsabilités

• Traitement et contrôle qualité des données RNA-seq
• Analyse différentielle et fonctionnelle
• Développement et optimisation de pipelines
• Comparaison avec des jeux de données publiés
• Interprétation biologique en lien avec les biologistes de l’équipe

Connaissances

RNAseq analysis

Differential expression

Pipeline development

Quality control

Isoform analysis

Mammalian transcriptome

Description du poste

CNRS à Paris, au sein du Laboratoire Développement, Adaptation et Vieillissement (IBPS), recrute pour un poste de chercheur/doctorant post-doctoral travaillant sur les perturbations post-transcriptionnelles liées à des mutations de l’hélicase DDX6. Vous analyserez des jeux RNA-seq et développerez des pipelines adaptés, en collaboration avec l’équipe mRNP et condensats.

Le candidat exercera son activité dans un cadre ANR, avec des modèles cellulaires humains et une interface étroite avec les