Ingénieur Bioinformatique & Transcriptomique — Données & ML

INSERM; Toulouse; Sur place; EUR 27 000 - 40 000; Plein temps

Résumé du poste

Inserm au CRCT de Toulouse recrute un bioinformaticien pour analyser des jeux de données transcriptomiques et intégrer des données omiques afin d’étudier la résistance dans les leucémies aiguës myéloïdes. Vous développerez des pipelines et des outils, et collaborerez avec une équipe dynamique.

Vous utiliserez R/Python, GitHub et des environnements UNIX, dans un cadre multidisciplinaire orienté recherche et innovation, en lien avec les partenaires hospitaliers et académiques.

Qualifications

• Expérience en bioinformatique transcriptomique (bulk et single cell).
• Connaissance des outils et bases de données bioinformatiques.
• Compétences en apprentissage automatique/profond pour signatures biologiques.

Responsabilités

• Développement de codes et analyses pour la transcriptomique bulk et single cell et l’intégration à d’autres données omiques.
• Développement de codes d’apprentissage automatique/apprentissage profond afin d’identifier des signatures métaboliques de la rechute/résistance.
• Faciliter l’interaction entre le groupe et les bioinformaticiens du CRCT et partenaires externes.
• Création d’interfaces web pour les outils bioinformatiques et les codes produits par le groupe.

Connaissances

Single cell analysis

Git & versioning

Data science & statistics

Unix

R/Python/Shell

Web portals development

Network visualization

Bioinformatics tools

Outils

GitHub

Description du poste

Inserm au CRCT de Toulouse recrute un bioinformaticien pour analyser des jeux de données transcriptomiques et intégrer des données omiques afin d’étudier la résistance dans les leucémies aiguës myéloïdes. Vous développerez des pipelines et des outils, et collaborerez avec une équipe dynamique.

Vous utiliserez R/Python, GitHub et des environnements UNIX, dans un cadre multidisciplinaire orienté recherche et innovation, en lien avec les partenaires hospitaliers et académiques.