Ingénieur Bioinformatique et Biologie Computationnelle

Inserm France; Paris; Hybride; EUR 33 000 - 36 000; Plein temps

Résumé du poste

L’Inserm, institut public dédié à la recherche biologique et médicale, recrute un ingénieur informaticien en biologie pour analyser des données single‑cell et multi‑omics et développer des modèles de régulation génique.

Le poste est basé à Paris, 38 h 30 par semaine, CDD de 24 mois avec télétravail partiel selon le projet. Compétences en R, Python et pipelines Nextflow/Snakemake requises. Forte interaction avec des biologistes expérimentaux et travail dans un environnement interdisciplinaire.

Qualifications

• Doctorat en biologie computationnelle ou domaine équivalent avec forte composante computationnelle.
• Expérience en analyses single-cell.
• Compétences en apprentissage automatique et/ou deep learning.
• Maîtrise de pipelines reproductibles (R, Python, Nextflow/Snakemake).

Responsabilités

• Analyser des données single-cell et multi-omics issues de cellules immunitaires et cérébrales.
• Intégrer des données transcriptomiques spatiales et d’imagerie avec des atlas single-cell.
• Analyse à l’échelle d’atlas et intégration de cohortes publiques et internes.
• Développement de modèles statistiques et d’apprentissage profond pour l’étude de la régulation génomique et des éléments transposables.
• Développement, optimisation et maintenance de pipelines reproductibles (R, Python, Nextflow/Snakemake).
• Contribution à la rédaction d’articles scientifiques et à la valorisation des résultats.

Connaissances

Bioinformatique

Biologie computationnelle

Single-cell analysis

Deep learning

Formation

Doctorat en biologie computationnelle

Outils

R

Python

Nextflow

Snakemake

Git

Description du poste

L’Inserm, institut public dédié à la recherche biologique et médicale, recrute un ingénieur informaticien en biologie pour analyser des données single‑cell et multi‑omics et développer des modèles de régulation génique.

Le poste est basé à Paris, 38 h 30 par semaine, CDD de 24 mois avec télétravail partiel selon le projet. Compétences en R, Python et pipelines Nextflow/Snakemake requises. Forte interaction avec des biologistes expérimentaux et travail dans un environnement interdisciplinaire.