Ingénieur Bioinformatique – RNA-seq & Transcriptome

CNRS; Paris; Hybride; EUR 28 000 - 42 000; Plein temps

Avantages offerts par ce poste

Indemnisation TT

Mobilité durable 300€

44 jours RTT

Résumé du poste

Le CNRS recrute pour déterminer les perturbations post-transcriptionnelles liées aux mutations dans l’hélicase DDX6 dans des cellules humaines. Le poste implique l’analyse de jeux RNA-seq, l’identification de transcrits dérégulés et l’interprétation biologique avec l’équipe de biologistes.

Intégré à l’unité mRNP et condensats, vous travaillerez sur le développement et l’optimisation de pipelines et sur l’analyse différentielle et fonctionnelle, avec collaboration étroite avec le post-doctorant

Qualifications

• Maîtrise des outils RNAseq : alignement, quantification, analyse différentielle, visualisation.
• Maîtrise des outils d’analyse des isoformes d’ARN.
• Expérience en analyse de transcriptome dans des modèles mammifères.
• Rigueur, autonomie, dynamisme et esprit d’initiative.
• Rédaction de rapports clairs et présentation des résultats à des non-bioinformaticiens.

Responsabilités

• Traiter et contrôler la qualité des données RNA-seq.
• Réaliser l’analyse différentielle et fonctionnelle.
• Développer et optimiser des pipelines d’analyse.
• Comparaison avec des jeux de données publiés.
• Interprétation biologique en lien avec l’équipe de biologistes.

Connaissances

RNA-seq outils maîtrise

Analyse des isoformes

Transcriptome analyse chez Mammifères

Rigueur et autonomie

Rédaction et présentation des results

Collaboration en équipe

Formation

BAC+5 en bioinformatique/biologie

Outils

RNA-seq pipelines

Outils d’analyse des isoformes

Description du poste

Le CNRS recrute pour déterminer les perturbations post-transcriptionnelles liées aux mutations dans l’hélicase DDX6 dans des cellules humaines. Le poste implique l’analyse de jeux RNA-seq, l’identification de transcrits dérégulés et l’interprétation biologique avec l’équipe de biologistes.

Intégré à l’unité mRNP et condensats, vous travaillerez sur le développement et l’optimisation de pipelines et sur l’analyse différentielle et fonctionnelle, avec collaboration étroite avec le post-doctorant