Ingénieur Bio-Informatique: Indexation NGS & Workflows

CHU DE MONTPELLIER; Montpellier; On-site; EUR 42,000 - 62,000; Full time

Job summary

Le CHU de Montpellier recherche un ingénieur en bio-informatique et informatique pour développer et maintenir la plateforme BIO2M, mettre en place les logiciels d’analyse de données de séquençage et automatiser les procédures avec Snakemake.

Vous gérerez les données, participerez à la formation des utilisateurs et interagirez avec les demandeurs de prestations pour concevoir les études et rendre les résultats.

Une double compétence en bio-informatique et informatique est souhaitée.

Qualifications

• Bioinformatique des traitements des données NGS
• Indexation de données et programmation
• Web développement

Responsibilities

• La création d'index à partir de cohortes (RNAseq/Omics).
• Utilisation et conception de gestionnaire de workflow.
• Maintien et amélioration du site Web (TranSipedia).
• Gestion des données et formation des utilisateurs.
• Contact avec les demandeurs de prestations pour la conception d'études et le rendu des résultats.

Skills

Bioinformatique

NGS analysis

RNAseq

Indexation de données

Programmation Python

Web développement

Snakemake

Gestion des données

Communication

Education

Master 2 bio-informatique

Tools

Snakemake

Reindeer

TranSipedia

Job description

Le CHU de Montpellier recherche un ingénieur en bio-informatique et informatique pour développer et maintenir la plateforme BIO2M, mettre en place les logiciels d’analyse de données de séquençage et automatiser les procédures avec Snakemake.

Vous gérerez les données, participerez à la formation des utilisateurs et interagirez avec les demandeurs de prestations pour concevoir les études et rendre les résultats.

Une double compétence en bio-informatique et informatique est souhaitée.