INGENIEUR BIO-INFORMATIQUE EN RECHERCHE

Hôpital Lapeyronie; Montpellier; On-site; EUR 48,000 - 64,000; Full time

Job summary

Hôpital Lapeyronie à Montpellier recherche un Ingénieur Bio-informatique en Recherche pour rejoindre la plateforme BIO2M. Vous développerez et allez automatiser les procédures d’analyse des données de séquençage haut débit, tout en gérant les index et les workflow associés.

Le poste implique la gestion des données et le soutien formation des utilisateurs, avec des échanges réguliers avec les demandeurs pour concevoir les études et présenter les résultats.

Responsibilities

• Participer à l'organisation de la plateforme BIO2M et mettre en place les logiciels d'analyse pour le traitement des données de séquençage haut débit.
• Assurer la mise à jour et les développements informatiques pour automatiser les procédures avec Snakemake et les logiciels de conception d'INDEX.
• Gérer les données et participer aux formations destinées aux utilisateurs.
• Être en contact avec les demandeurs de prestations pour la conception de l'étude et le rendu des résultats.
• Créer des index à partir de cohortes RNAseq ou Omics fournies par les demandeurs.
• Utiliser et concevoir des gestionnaires de workflow.
• Maintenir et améliorer le site Web TranSipédia.

Skills

Bio-informatique

Snakemake

Gestion de workflow

Gestion de données

Job description

Détails de l’offre

Poste proposé INGENIEUR BIO-INFORMATIQUE EN RECHERCHE Contrat CDD Descriptif DEFINITION

Ingénieur en Bio-informatique et en informatique

ACTIVITES PRINCIPALES

L'ingénieur(e) participera à l'organisation de la plateforme BIO2M. Il mettra en place les logiciels d'analyse pour le traitement des données de séquençage haut débit, assurera leur mise à jour et les développements informatiques pour automatiser les procédures avec le logiciel de gestion (Snakemake) et les logiciels de conception d'INDEX de données à grande échelle. Nous recrutons un ingénieur informaticien/bio-informaticien expérimenté pour les taches désignées.

La personne sera également en charge de la gestion des données et participera aux formations qui seront développées pour les utilisateurs

La personne sera en contact avec les demandeurs de prestations pour la conception de l'étude et le rendu de résultats

ACTIVITES SPECIFIQUES LIEES AU POSTE

Les activités spécifiques liées au poste sont :

• la création d'index à partir de cohortes (données RNAseq ou Omics) fournies par les demandeurs d'un projet.
• L'utilisation et la conception de gestionnaire de workflow
• Le maintien et l'amélioration du site Web (TranSipedia)

Etablissement

Hôpital Lapeyronie

371 avenue du Doyen Gaston Giraud

34295 MONTPELLIER

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