Forskare i hybridisering och copy number variation

Lund University; Lunds kommun; On-site; SEK 450,000 - 550,000; Full time

Job summary

Lund University i Lund söker en forskare tidig karriär inom Runemarklabbet för ett karriärutvecklingsprojekt. Forskaren kommer att arbeta med kopynumber‑variation och dess påverkan på genuttryck i jästhybrider och deras founder‑stammar, samt syntetisera arbetet för publikation.

Du kommer att arbeta nära HybridExpress‑teamet med en labmanager, en doktorand och två postdocs och få mentorskap. Kraven inkluderar doktorsexamen i evolutionär genomik och stark kompetens i bioinformatik, R, Perl och

Qualifications

• Doktorsexamen eller motsvarande bedömd examen inom evolutionär genomik.
• Stark erfarenhet av bioinformatik och analys av genomiska data.
• Erfarenhet av att studera copy number variation och dess funktionella betydelse.

Responsibilities

• Utföra bioinformatiska analyser av CNV och genomiska prediktorer för CNVs.
• Analysera CNV‑variation i hybrider och föräldraarter och bedöma effekter på genuttryck.
• Tolka resultat och skapa figurmaterial inför publicering.
• Syntetisera data för publicering.

Skills

bioinformatisk analys

CNV‑analys

R

Perl

Unix

Education

Doktorsexamen i evolutionär genomik

Tools

Genomisk analys

Job description

Ämnesbeskrivning

Vi rekryterar en forskare tidigt i karriären för en karriärsutvecklingsposition inom Runemarklabbet, med arbete i VR-projektet “The role of novel patterns of gene expressoin in hybrid adaptation”.

Projektet undersöker genuttryckets roll i hur ny variation och evolutionära anpassningar kan uppstå genom hybridisering. Projektets huvudfråga gäller hur strukturella varianter, i synnerhet copy number variation (CNV) bidrar till detta.

Vi samlar för närvarande prover till ett unikt dataset av jästhybrider och deras founder strains under flera stressförhållanden och repeterad meios för att bredda vår insikt inom detta fält.

Forskaren kommer att samarbeta nära med kollegor, genomföra analyser av strukturella varianter i föräldraarter och hybrider med fokus på copy number variation och dess effekter på genuttryck, samt syntetisera arbetet för publikation.

Forskaren kommer att arbeta nära HybridExpress-teamet bestående av en labmanager, en doktorand och två post docs. Det kommer att finnas möjligheter till mentorskap. Projektet leds av universitetslektor Anna Runemark vars labb är en del av SPeciation, Adaptation and Co-Evolution gruppen inom divisionen biologisk mångfald och evolution.

Arbetsuppgifter

De huvudsakliga uppgifterna i en forskartjänst är att bedriva forskning.

Detaljerad Beskrivning Av Arbetsuppgifterna

• Bioinformatisk analys av CNV och genomiska prediktorer för CNVs, inklusive transposabla element och metylering
• Analys av CNV-variation i hybrider och föräldraarter med fokus på deras effekter på genuttryck
• Tolkning av bioinformatiska resultat, figurberedning
• Syntetisera data för publicering

Krav för anställningen

För anställning till denna karriärutvecklingstjänst krävs att den sökande har en doktorsexamen, eller en internationell examen som bedöms likvärdig med en doktorsexamen, inom evolutionär genomik. Även om det inte finns några formella krav på karriärålder, syftar tjänsten till karriärutveckling för en forskarkarriär och meriter kommer att beaktas i ljuset av karriäråldern.

Övriga Krav Är

• Starka erfarenheter av bioinformatik, inklusive analys av hybridgenom.
• Expertis i att detektera och analysera copynumber variation och att undersöka dess funktionella och evolutionära signifikans.
• Erfarenhet av att utveckla statisktiska metoder och bioinformatiska verktyg för analys av genomisk data.
• Färdighet i att analysera stora genomiska och transkriptomi dataset med R, Perl och Unix.
• Erfarenhet av att självständigt driva ett mikrobiskt laboratorium under kortare tid.

Meriterande för anställningen

Detta är en position menad för karriärsutveckling för en framtida akademisk karriär med forskningsfokus. Positionen är tänkt som ett tidigt steg i en karriär och utvärdering av sökande kommer primärt baseras på deras forskningskvalifikationer och potential som forskare. Särskild tyngd kommer läggas på färdigheter inom forskningsämnet i.e., hybridiseringsgenomik i synnerhet analys av strukturella varianter i form av copy number variants.

• God förmåga att utveckla och genomföra forskning av hög kvalitet, vilket bedöms av publikationshistorik med starka självständiga bidrag och publikationer av hög kvalitet; samt demonstrerad förmåga att kommunicera forskningsresultat på internationella konferenser.
• Ett starkt track-record av att utveckla egen forskning, vilket bedöms av uppvisande av högt meriterade anslagsansökningar.
• Starka erfarenheter av bioinformatik, inklusive analys av metylering och histonmodifiering, genuttrycksdata och/eller analys av hybridgenom.

Övriga egenskaper som kommer tas i beaktande är goda samarbetsegenskaper, handlingskraftighet och självständighet, samt hur sökandens erfarenhet och färdigheter kompletterar den pågående forskningen inom institutionen och dess utveckling.

Villkor

Detta är en tillsvidareanställning på heltid, med start 2026-12-15, provanställning i 6 månader kan komma att tillämpas.

Kontaktperson: Anna Runemark, [e-mail]