Postdoktor i multivariata modeller för spatial genomik

Uppsala Universitet; Uppsala kommun; On-site; SEK 424,080 - 535,680; Full time

Job summary

Ett svenskt universitet söker en postdoktor inom multivariata modeller för spatial genomik. Du kommer att utveckla analysmetoder och samarbeta med forskare inom innovativ teknik. Krav är doktorsexamen samt erfarenhet av riktad biostatistik. Tjänsten är heltid och tidsbegränsad i 2 år, med möjlighet till förlängning. Tillträde enligt överenskommelse. Ansök senast den 20 april 2026.

Qualifications

• Doktorsexamen ska vara uppfylld senast vid anställningsbeslutet.
• Tidigare erfarenhet av använde analysmetoder är att föredra.
• Stark muntlig och skriftlig kommunikationsförmåga krävs.

Responsibilities

• Utveckla nya beräkningsmetoder för att analysera RNA-sekvenser.
• Skriva algoritmer och distribuera verktyg för dataanalys.
• Samarbeta med experimentella kollegor.

Skills

Bayesiansk inferens

Grafmodeller

Multivariata modeller

Bildanalys

Kommunikationsförmåga

Projektledning

Education

Doktorsexamen i beräkningsbiologi, statistik, tillämpad matematik

Job description

Postdoktor i multivariata modeller för spatial genomik

Uppsala universitet, Institutionen för immunologi, genetik och patologi

Institutionen för immunologi, genetik och patologi vid Uppsala universitet har en bred forskningsprofil med starka forskargrupper inriktade på bl. a cancer, genetiska och autoimmuna sjukdomar. En av de bärande tankarna vid institutionen är att stimulera translationell forskning och därmed främja en närmare samverkan mellan medicinsk forskning och sjukvården. Forskning bedrivs inom sex forskningsprogram: cancerprecisionsmedicin, cancerimmunterapi, genomik och neurobiologi, molekylära verktyg och funktionsgenomik, neuroonkologi och neurodegeneration samt vaskulärbiologi. Delar av verksamheten är även integrerad med avdelningarna för onkologi, klinisk genetik, klinisk immunologi, klinisk patologi och sjukhusfysik vid Akademiska sjukhuset. Institutionen har undervisningsuppdrag på ett antal programutbildningar, fristående kurser och internationella masterprogram inom den medicinska fakulteten. Institutionen omsätter omkring 550 miljoner kronor, varav ca två tredjedelar är externa forskningsbidrag. Antalet anställda är ca 400, varav ca 100 är doktorander, och det finns totalt över 850 verksamma i arbetsstyrkan.

Vickovic Lab vid Uppsala universitet söker en dynamisk, självgående, teamorienterad postdoktor för att utöka sina beräkningsinsatser för att förstå sjukdomsmekanismer genom integration av fluorescensavbildnings- och sekvenseringsdata för att bygga multivariata spatialmodeller. Vi är intresserade av att utveckla integrativa multimodala dataanalysverktyg som innehåller multimodala spatialupplösta omik. Den framgångsrika kandidaten kommer att ha den unika möjligheten att arbeta i skärningspunkten mellan matematisk modellering, datorseende, omikdataanalys, arbetsflödesoptimering och resursuppbyggnad. Den postdoktorala forskaren kan också föreslå och driva sina egna idéer som passar laboratoriets allmänna forskningsprogram (se https://www.vickovictechinnovation.com/).

Arbetsuppgifter

• Utveckla nya beräknings-, maskininlärnings- och statistiska analysmetoder för att integrera och analysera storskaliga, spatialupplösta RNA-sekvenserings- och genotypdata med hjälp av aktuell toppmodern teknik.
• Utveckla strategier för dataanalys, skriva algoritmer och distribuera beräkningsverktyg för utforskning av mycket stora datamängder.
• Utveckla en resurs för gemenskapen som ger tillgång till insamlad data.
• Samarbeta nära experimentella kollegor och kärnor för att förstå den genererade datans natur.
• Delta aktivt i förberedelserna av manuskript för publicering och presentera på vetenskapliga konferenser.
• Bistå med mentorskap för kollegor och studenter.
• Dela expertis och ge utbildning och vägledning till gruppmedlemmar efter behov.

Kvalifikationskrav

• Doktorsexamen i beräkningsbiologi, statistik, tillämpad matematik, datavetenskap eller relaterad disciplin krävs eller en utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen i detsamma. Examen ska vara uppfyllt senast vid tidpunkten då anställningsbeslutet fattas. Främst bör den komma ifråga som har avlagt examen för högst tre år sedan. Vid beräkning av ramtiden om tre år är utgångspunkten sista ansökningsdag. Om det finns särskilda skäl kan sådan examen ha avlagts tidigare. Med särskilda skäl avses ledighet på grund av sjukdom, föräldraledighet, förtroendeuppdrag inom fackliga organisationer, etc.
• Tidigare erfarenhet av Bayesiansk inferens, grafmodeller, multivariata modeller och bildanalys är att föredra, men exceptionellt kreativa och drivna forskare med intresse och anpassningsförmåga kommer att övervägas seriöst.
• Stark muntlig och skriftlig kommunikationsförmåga, datadokumentation och presentationsförmåga krävs.
• Erfarenhet av att skriva vetenskapliga artiklar för publicering krävs.
• Förmåga att hantera flera projekt samtidigt krävs.
• Utmärkta samarbets- och interpersonella färdigheter, samt en vilja att arbeta i en snabb teammiljö krävs.

Meriterande

• Tekniska och professionella färdigheter: Visar konsekvent färdigheter och kunskaper som är relevanta för nuvarande roll; strävar efter att utöka djupet och bredden av tekniska och professionella färdigheter; arbetar med hög integritet; uppvisar fokus och disciplin; prioriterar på lämpligt sätt, hanterar förväntningar och levererar åtaganden.
• Samarbetande och kommunikativ: Modellerar samarbete och lagarbete; får fram det bästa hos andra; arbetar effektivt med alla nivåer, internt och externt; respekterar och omfamnar mångfald av perspektiv; kommunicerar tydligt och lyssnar noga; Använder gott omdöme när det gäller vad som ska kommuniceras och när det ska göras.
• Anpassningsbar och innovativ: Anpassningsbar och omfamnar förändring; utvecklar nya insikter och strävar efter förbättringar och effektivitet; främjar utbyte av nya idéer och är villig att utmana status quo; tar initiativ och är lösningsorienterad; engagerar sig i arbetet med passion och nyfikenhet.

Om anställningen

Anställningen är tidsbegränsad i 2 år enligt centralt kollektivavtal med möjlighet till 1 års förlängning. Omfattningen är heltid. Tillträde enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala

Upplysningar om anställningen lämnas av: Sanja Vickovic, [e-mail]

Välkommen med din ansökan senast den 20 april 2026, UFV-PA 2026/861

Anställningen kan komma att säkerhetsprövas. Vid säkerhetsprövning är en förutsättning för anställning att sökande blir godkänd.