Researcher in hybridization and copy number variation

Lunds Universitet; Lunds kommun; On-site; SEK 520,000 - 660,000; Full time

Job summary

Lunds universitet söker en forskare i hybridisering och copy number variation som arbetar i Runemarklabbet. Du kommer att analysera CNV i jästhybrider och föräldraarter och undersöka hur CNV påverkar genuttrycket, samt bidra till publikationer.

Projektet leds av Anna Runemark och erbjuder mentorskap i ett TVårsmekaniskt forskningsmiljö med möjlighet att utveckla din karriär inom evolutionär genomik.

Qualifications

• Doktorsexamen eller motsvarande inom evolutionär genomik.
• Starka färdigheter i bioinformatik och CNV-analys.
• Erfarenhet av att utveckla statistiska metoder för genomisk data.
• Färdigheter i R, Perl och Unix.
• Erfarenhet av laboratoriearbete i mikrobiell modell.

Responsibilities

• Bioinformatiska analyser av CNV och genometprediktorer.
• Analys av CNV-variation i hybrider och föräldraarter.
• Tolkning av resultat och figurberedning.
• Syntetisera data för publicering.

Skills

Bioinformatik

CNV-analys

Genomisk analys

Hybridgenomik

Statistiska metoder

R-programmering

Perl

Unix

Education

Doktorsexamen i evolutionär genomik

Tools

R

Perl

Unix

Job description

Forskare i hybridisering och copy number variation

Lunds universitet grundades 1666 och rankas återkommande som ett av världens främsta lärosäten. Här finns omkring 46 000 studenter och 8 500 medarbetare i Lund, Helsingborg och Malmö. Vi förenas i vår strävan att förstå, förklara och förbättra vår värld och människors villkor.

Lunds universitet välkomnar sökande med olika bakgrund och erfarenheter. Jämställdhet, lika villkor och mångfald är grundläggande principer för alla delar av vår verksamhet.

Vi rekryterar en forskare tidigt i karriären för en karriärsutvecklingsposition inom Runemarklabbet, med arbete i VR-projektet “The role of novel patterns of gene expressoin i hybrid adaptation”.

Projektet undersöker genuttryckets roll i hur ny variation och evolutionära anpassningar kan uppstå genom hybridisering. Projektets huvudfråga gäller hur strukturella varianter, i synnerhet copy number variation (CNV) bidrar till detta.

Vi samlar för närvarande prover till ett unikt dataset av jästhybrider och deras founder strains under flera stressförhållanden och repeterad meios för att bredda vår insikt inom detta fält.

Forskaren kommer att samarbeta nära med kollegor, genomföra analyser av strukturella varianter i föräldraarter och hybrider med fokus på copy number variation och dess effekter på genuttryck, samt syntetisera arbetet för publikation.

Forskaren kommer att arbeta nära HybridExpress-teamet bestående av en labmanager, en doktorand och två post docs. Det kommer att finnas möjligheter till mentorskap. Projektet leds av universitetslektor Anna Runemark vars labb är en del av SPeciation, Adaptation and Co-Evolution gruppen inom divisionen biologisk mångfald och evolution.

De huvudsakliga uppgifterna i en forskartjänst är att bedriva forskning.

Detaljerad beskrivning av arbetsuppgifterna:

• Bioinformatisk analys av CNV och genomiska prediktorer för CNVs, inklusive transposabla element och metylering
• Analys av CNV-variation i hybrider och föräldraarter med fokus på deras effekter på genuttryck
• Tolkning av bioinformatiska resultat, figurberedning
• Syntetisera data för publicering

Krav för anställningen

För anställning till denna karriärutvecklingstjänst krävs att den sökande har en doktorsexamen, eller en internationell examen som bedöms likvärdig med en doktorsexamen, inom evolutionär genomik. Även om det inte finns några formella krav på karriärålder, syftar tjänsten till karriärutveckling för en forskarkarriär och meriter kommer att beaktas i ljuset av karriäråldern.

Övriga krav är:

• Starka erfarenheter av bioinformatik, inklusive analys av hybridgenom.
• Expertis i att detektera och analysera copynumber variation och att undersöka dess funktionella och evolutionära signifikans.
• Erfarenhet av att utveckla statisktiska metoder och bioinformatiska verktyg för analys av genomisk data.
• Färdighet i att analysera stora genomiska och transkriptomi dataset med R, Perl och Unix.
• Erfarenhet av att självständigt driva ett mikrobiskt laboratorium under kortare tid.

Meriterande för anställningen

Detta är en position menad för karriärsutveckling för en framtida akademisk karriär med forskningsfokus. Positionen är tänkt som ett tidigt steg i en karriär och utvärdering av sökande kommer primärt baseras på deras forskningskvalifikationer och potential som forskare. Särskild tyngd kommer läggas på färdigheter inom forskningsämnet i.e., hybridiseringsgenomik i synnerhet analys av strukturella varianter i form av copy number variants.

• God förmåga att utveckla och genomföra forskning av hög kvalitet, vilket bedöms av publikationshistorik med starka självständiga bidrag och publikationer av hög kvalitet; samt demonstrerad förmåga att kommunicera forskningsresultat på internationella konferenser.
• Ett starkt track-record av att utveckla egen forskning, vilket bedöms av uppvisande av högt meriterade anslagsansökningar.
• Starka erfarenheter av bioinformatik, inklusive analys av metylering och histonmodifiering, genuttrycksdata och/eller analys av hybridgenom.

Övriga egenskaper som kommer tas i beaktande är goda samarbetsegenskaper, handlingskraftighet och självständighet, samt hur sökandens erfarenhet och färdigheter kompletterar den pågående forskningen inom institutionen och dess utveckling.

Detta är en tillsvidareanställning på heltid, med start 2026-12-15, provanställning i 6 månader kan komma att tillämpas.

Anställningsform Tillsvidareanställning

Anställningens omfattning

Tillträde

Tillträde Preliminärt 2026-12-15 eller enligt överenskommelse

Löneform Månadslön

Antal lediga befattningar

Sysselsättningsgrad

Län Skåne län

Referensnummer

Facklig företrädare

• OFR/ST:Fackförbundet ST:s kansli, 046-2229362, [e-mail]
• SACO:Saco-s-rådet vid Lunds universitet, 046-2220000, [e-mail]

Vid Naturvetenskapliga fakulteten bedrivs forskning och utbildning inom astronomi, biologi fysik, geovetenskap, kemi, matematik, medicinsk strålningsfysik, miljövetenskap och naturgeografi. Verksamheten bedrivs inom norra universitetsområdet. Fakulteten har ca 1 900 studenter, 330 forskarstuderande och 730 anställda.

Vi undanber oss alla kontakter från annonsförsäljare, rekryterings- och bemanningsföretag på grund av statliga upphandlingsregler.

Anställningsform Tillsvidareanställning