Ingénieur·e Bioinformatique | RNA-seq & Multi-omics

CNRS; Lyon; Hybrid; EUR 26,000 - 31,000; Full time

Benefits offered by this job

44 jours RTT

Indemnisation TT

Forfait mobilité durable 300€

Job summary

L’Institut de Génomique Fonctionnelle de Lyon (IGFL), unité CNRS, recherche un ingénieur bioinformaticien pour analyser des données bulk RNA-seq et scRNA/ATAC multi-omiques chez la souris, caractérisant populations cellulaires et mécanismes de régulation.

Vous définirez avec l’équipe le plan d’étude, identifierez les outils adaptés, réaliserez les analyses et développez des outils pour diffuser les données à la communauté scientifique, avec publication et présentations à l’appui.

Qualifications

• Licence en sciences de la vie et Master en bioinformatique requis ou équivalent.
• Connaissances solides en R et Python.
• Expérience avecRNA-seq et multi-omics.
• Connaissance des pipelines bioinformatiques et de l'analyse de données.
• Maîtrise Linux/Unix et scripting.

Responsibilities

• Définir le plan d'étude avec l'équipe.
• Identifier les outils de bioinformatique adaptés.
• Réaliser les analyses de données RNA-seq et multi-omics.
• Intégrer des données publiques et vulgariser les résultats.
• Développer et diffuser des outils pour la communauté.
• Rédiger des rapports et présentations.

Skills

Master en bioinformatique

R et Python

Linux/Unix CLI

RNA-seq multi-omics

Pipelines multi-omics

Anglais scientifique

Git versioning

Shiny visualization

SLURM

Esprit d'équipe

Education

Licence en sciences de la vie

Master en bioinformatique

Tools

Cell Ranger ARC

SCENIC+

CellOracle

ICELLNET

Git

SLURM

Shiny

Linux/Unix CLI

Job description

L’Institut de Génomique Fonctionnelle de Lyon (IGFL), unité CNRS, recherche un ingénieur bioinformaticien pour analyser des données bulk RNA-seq et scRNA/ATAC multi-omiques chez la souris, caractérisant populations cellulaires et mécanismes de régulation.

Vous définirez avec l’équipe le plan d’étude, identifierez les outils adaptés, réaliserez les analyses et développez des outils pour diffuser les données à la communauté scientifique, avec publication et présentations à l’appui.