Ingénieur·e Analyse Multi-Omics Single-Cell

INSERM; Paris; On-site; EUR 42,000 - 62,000; Full time

Job summary

L’Inserm recherche un ingénieur·e analyse pour les données multi-omiques en cellule unique, intégré au projet ACTA et coordonné avec l’Institut Gustave Roussy. Vous apporterez un soutien aux projets de programmation et collaborerez avec les biologistes et partenaires du consortium.

Vous maîtrisez les analyses de données transcriptomiques et génomiques, le développement de pipelines et le travail sur cluster HPC, avec une sensibilité forte à la qualité des données et à la reproductibilité.

Qualifications

• Maîtrise des concepts de biologie moléculaire et cellulaire et de génomique.
• Connaissances en analyse de données de séquençage à haut débit et en cellule unique.
• Notions de statistiques appliquées à la biologie et apprentissage automatique.
• Anglais scientifique lu, écrit et parlé.

Responsibilities

• Contrôle qualité, prétraitement et analyse de données single-cell transcriptomiques et génomiques
• Étude de l’impact des aneuploïdies sur l’expression génique et l’hétérogénéité clonale
• Intégration, exploration et visualisation de données multi-omiques ; analyses d’enrichissement fonctionnel
• Développement, documentation et maintenance de scripts et de pipelines reproductibles (R, Python, Bash), y compris sur cluster de calcul
• Gestion et organisation des données selon les principes FAIR
• Assistance aux membres de l’équipe sur leurs projets de programmation
• Restitution des résultats à l’équipe et aux partenaires du consortium ; participation à la rédaction des rapports et des publications

Skills

Biologie moléculaire

Génomique

Hématologie

Anglais scientifique

R

Python

Bash

HPC

Tools

Seurat

Scanpy

DESeq2

edgeR

Bioconductor

Job description

L’Inserm recherche un ingénieur·e analyse pour les données multi-omiques en cellule unique, intégré au projet ACTA et coordonné avec l’Institut Gustave Roussy. Vous apporterez un soutien aux projets de programmation et collaborerez avec les biologistes et partenaires du consortium.

Vous maîtrisez les analyses de données transcriptomiques et génomiques, le développement de pipelines et le travail sur cluster HPC, avec une sensibilité forte à la qualité des données et à la reproductibilité.