Ingénieur bio-informatique – Génomique & Climat des Plantes

IRD; Montpellier; Hybrid; EUR 42,000 - 56,000; Full time

Benefits offered by this job

Congés 32 jours + RTT

Restauration collective

Mutuelle MGEN

Mobilité et transport

Télétravail 1–3 jours/semaine

Job summary

IRD recherche un/la bio-informaticien(ne) pour contribuer à des projets en génomique et adaptation des plantes face au climat. Vous intégrerez l'équipe Dynadiv, UTtverse DIADE à Montpellier, avec collaboration active avec INRAE, CIRAD et autres unités, et vous développerez des outils et scripts en environnement HPC.

Le poste requiert un diplôme de niveau 7 (Ingénieur/Master) et une expérience en bio-informatique; télétravail partiel possible et travail en équipe seront privilégiés.

Qualifications

• Diplôme de niveau 7, ingénieur et/ou Master avec expérience en bio-informatique.
• Maîtrise UNIX et manipulation de données sur HPC; connaissance de conteneurisation (Docker, Apptainer).
• Maîtrise Python et R; notions en C, et connaissance des données de séquençage.
• Connaissances en biologie et analyse de données de séquençage.

Responsibilities

• Développer des outils bio-informatiques pour l'adaptation des plantes face aux variations climatiques et futures projections.
• Construire des briques logicielles et les intégrer dans un outil existant; valider les scripts sur divers modèles végétaux et proposer des tutoriels et formations.
• Prendre en compte l'incertitude des données ADN ancien dans l'analyse bio-informatique et étudier la diversité et l'adaptation au climat.

Skills

UNIX

HPC

Python

R

C

Docker

Apptainer

Education

Master ou diplôme d'ingénieur en bio-informatique

Tools

Docker

Apptainer

Job description

IRD recherche un/la bio-informaticien(ne) pour contribuer à des projets en génomique et adaptation des plantes face au climat. Vous intégrerez l'équipe Dynadiv, UTtverse DIADE à Montpellier, avec collaboration active avec INRAE, CIRAD et autres unités, et vous développerez des outils et scripts en environnement HPC.

Le poste requiert un diplôme de niveau 7 (Ingénieur/Master) et une expérience en bio-informatique; télétravail partiel possible et travail en équipe seront privilégiés.