Ingénieur R&D Bioinformatique Phylogénomique

CNRS; Saint-Martin-d'Hères; Híbrido; EUR 33 000 - 39 000; Tempo integral

Vantagens oferecidas por esta oferta de emprego

Télétravail partiel possible

44 jours de RTT

Indemnisation du télétravail

Mobilité durable 300€

Resumo da oferta

CNRS recrute un ingénieur de recherche en bioinformatique pour développer un pipeline de phylogénomique au sein de l’Institut français de bioinformatique (IFB). Le poste, basé à Grenoble, implique le travail en équipe et le déploiement de workflows robustes dans un cadre national et international.

Le candidat doit maîtriser Nextflow, Python et Linux, avec une expérience en pipelines et technologies associées (Apptainer). Télétravail partiel possible et 38h30/semaine.

Qualificações

• Master 2 ou équivalent en bioinformatique ou domaine associé.
• Connaissance des méthodes et outils d’assemblage et d’inférence phylogénétique.
• Maîtrise Linux, workflow Nextflow et bonnes pratiques de développement.

Responsabilidades

• Concevoir et déployer un pipeline de phylogénomique standardisé (Nextflow).
• Améliorer robustesse et automatisation des étapes critiques et détection d’homologie.
• Valider les performances et détecter les biais affectant l’inférence phylogénétique.
• Faciliter adoption du pipeline auprès des équipes et partenaires.
• Réaliser un état de l’art et contribuer à publications et rapports techniques.
• Former les utilisateurs et assurer un support technique.

Conhecimentos

Linux

Nextflow

Python

Pipeline development

FAIR principles

Compute cluster

Apptainer

Technical English

Teamwork

Formação académica

Master 2 en Bioinformatique/biologie évolutive/génomique

Ferramentas

Apptainer

Descrição da oferta de emprego

CNRS recrute un ingénieur de recherche en bioinformatique pour développer un pipeline de phylogénomique au sein de l’Institut français de bioinformatique (IFB). Le poste, basé à Grenoble, implique le travail en équipe et le déploiement de workflows robustes dans un cadre national et international.

Le candidat doit maîtriser Nextflow, Python et Linux, avec une expérience en pipelines et technologies associées (Apptainer). Télétravail partiel possible et 38h30/semaine.