Bioinformaticien(ne) Génome & NGS — Pipelines et Outils

Chu Lyon; Bron; On-site; EUR 27,000 - 45,000; Full time

Job summary

Les Hospices Civils de Lyon – Cellule Bioinformatique recrutent un bioinformaticien(ne) généraliste pour développer et maintenir des outils d’analyse NGS et assurer la mise en production des pipelines au sein de l’infrastructure des HCL.

Le candidat, diplômé d’un Master 2 ou équivalent et avec au moins 3 ans d’expérience en NGS, fera preuve de rigueur, d’autonomie et de bonnes capacités pédagogiques pour travailler avec les biologistes et cliniciens.

Qualifications

• Diplôme de niveau Master 2, Ingénieur ou Doctorat en bioinformatique ou domaine connexe.
• 3 ans minimum d’expérience dans l’analyse de données NGS.
• Capacité à développer, maintenir et mettre à jour des outils bioinformatiques et pipelines.

Responsibilities

• Développement de pipelines ou de logiciels d’analyse bioinformatique et mise en production dans l’infrastructure HCL.
• Support et formation des utilisateurs.
• Automatisation de tâches et mise à jour des bases de données utilisées pour l’annotation.
• Participation à l’activité diagnostique courante et au suivi des analyses de routine.
• Développement de nouvelles fonctionnalités dans l’application web associée.

Skills

NGS data analysis

Bioinformatics tools

Bash/Perl/Python

R programming

SQL databases

Linux/Unix

Git versioning

Docker/Singularity

SLURM scheduling

Scientific presentation

Education

Master 2 in Bioinformatics

Tools

PHP

SQL

Job description

Les Hospices Civils de Lyon – Cellule Bioinformatique recrutent un bioinformaticien(ne) généraliste pour développer et maintenir des outils d’analyse NGS et assurer la mise en production des pipelines au sein de l’infrastructure des HCL.

Le candidat, diplômé d’un Master 2 ou équivalent et avec au moins 3 ans d’expérience en NGS, fera preuve de rigueur, d’autonomie et de bonnes capacités pédagogiques pour travailler avec les biologistes et cliniciens.