Early-Career Epigenetics & Hybrid Gene Expression Researcher

Lund University; Lunds kommun; On-site; SEK 536,000 - 692,000; Full time

Job summary

Lunds universitet söker en forskare i hybriders epigenetik och genuttryck som leder labsstrategin för cut-and-run-extraktioner och analyserar metylering samt ATAC-seq data. Du kommer att samarbeta nära kollegor och leda publiceringsarbete inom ERC-projektet.

Tjänsten är en tillsvidareanställning på heltid i Lund. Den sökande förväntas ha doktorsexamen inom biologi eller evolutionär biologi med bioinformatiska metoder och erfarenhet av reproducibla arbetsflöden samt nf-core-pipelines.

Qualifications

• Doktorsexamen eller internationell examen bedömd likvärdig med doktorsexamen inom biologi eller evolutionär biologi med bioinformatiska metoder eller evolutionära frågeställningar.
• Starka erfarenheter av bioinformatik och epigenetik, inklusive analys av metylering och histonmodifieringar, genuttrycksdata och/eller analys av hybridgenom.
• Dokumenterad erfarenhet av analys av EMseq data.
• Dokumenterad förmåga att utveckla reproducibla arbetsflöden såsom Nextflow.
• Erfarenhet av att använda nf-core pipelines (rnaseq, methylseq, differentialabundance, sarek).

Responsibilities

• Bioinformatisk analys av genuttrycksdata.
• Analys av metylering och histonmodifieringar och cut-and-rundata, med fokus på deras effekter på genuttryck.
• Tolknings av bioinformatiska resultat och figurberedning.
• Syntetisera data för publicering.

Education

Doktorsexamen

Tools

nf-core/rnaseq

nf-core/methylseq

nf-core/differentialabundance

nf-core/sarek

Nextflow

Job description

Lunds universitet söker en forskare i hybriders epigenetik och genuttryck som leder labsstrategin för cut-and-run-extraktioner och analyserar metylering samt ATAC-seq data. Du kommer att samarbeta nära kollegor och leda publiceringsarbete inom ERC-projektet.

Tjänsten är en tillsvidareanställning på heltid i Lund. Den sökande förväntas ha doktorsexamen inom biologi eller evolutionär biologi med bioinformatiska metoder och erfarenhet av reproducibla arbetsflöden samt nf-core-pipelines.