Stagiaire Bioinformatique Single-Cell — GBM & Cibles

SERVIER; Gif-sur-Yvette; On-site; EUR 10,000 - 13,000; Full time

Benefits offered by this job

Télétravail partiel

Horaires flexibles

Salle de sport gratuite

Navettes Servier

Avantages Groupe

Well Platinum (bien-être des employés)

Job summary

Servier Paris-Saclay R&D Institute, Gif-sur-Yvette (91), propose un stage de Biologiste Computationnel dans l’équipe In Silico Target Insight, dédié à l’analyse d’un atlas single-cell des tumeurs cérébrales agressives et à la découverte de biomarqueurs et cibles thérapeutiques potentielles.

Vous contribuerez à la construction d’un pipeline robuste couvrant QC, normalisation, clustering et annotation cellulaire, et à l’évaluation de voies et réseaux de signalisation; vous communiquerez vos

Qualifications

• Formation: Master 2 ou dernière année d’école d’ingénieurs avec spécialisation bioinformatique/biostatistique/biologie computationnelle.
• Maîtrise des outils d’analyse single-cell sur Python (scanpy, anndata, numpy) et R (Seurat, inferCNA, scDblFinder).
• Utilisation d’outils de reproductibilité (Nextflow, pip/uv/pixi). Environnement (bash, HPC, Git).

Responsibilities

• Mettre en œuvre et optimiser un pipeline d’analyse single-cell (QC, normalisation, clustering, réduction de dimension et annotation cellulaire).
• Évaluer la pertinence de cibles thérapeutiques et de voies de signalisation dans des sous-populations cellulaires.
• Inférer des réseaux de signalisation et co-activation pour caractériser les profils cellulaires.
• Présenter les résultats de manière pédagogique lors de réunions techniques avec les bio-informaticiens et biologistes.

Skills

Single-cell analysis

Python (scanpy)

R (Seurat)

Bioinformatics

Communication orale

Education

Master 2 en bioinformatique/biostatistique/biologie computationnelle

Dernière année d’école d’ingénieurs

Tools

Nextflow

Shell (bash)

Git

HPC

Job description

Servier Paris-Saclay R&D Institute, Gif-sur-Yvette (91), propose un stage de Biologiste Computationnel dans l’équipe In Silico Target Insight, dédié à l’analyse d’un atlas single-cell des tumeurs cérébrales agressives et à la découverte de biomarqueurs et cibles thérapeutiques potentielles.

Vous contribuerez à la construction d’un pipeline robuste couvrant QC, normalisation, clustering et annotation cellulaire, et à l’évaluation de voies et réseaux de signalisation; vous communiquerez vos