Stage Biologiste Computationnel - Données Single-Cell

Servier France; Gif-sur-Yvette; Sur place; EUR 13 000 - 18 000; Plein temps

Avantages offerts par ce poste

Télétravail jusqu’à 8 jours par mois

Horaires flexibles

Accès gratuit à la Salle de sport

Résumé du poste

Servier France, au sein du Servier Paris-Saclay R&D Institute à Gif-sur-Yvette, propose un stage de Biologiste Computationnel (H/F) pour 6 mois à partir du premier trimestre 2027. Vous travaillerez dans l’équipe In Silico Target Insight sur un atlas single-cell dédié aux tumeurs cérébrales.

Vous analyserez des données single-cell avec Python et R, mettrez en place un pipeline robuste (QC, normalisation, clustering) et évaluerez des cibles et voies de signalisation.

Qualifications

• Formation: Étudiant(e) en Master 2 ou dernière année d’école d’ingénieur, spécialisation en bioinformatique ou biologie computationnelle.
• Hardskills: maîtrise des outils single-cell en Python (Scanpy, AnnData, NumPy) et en R (Seurat, inferCNA, scDblFinder); outils de reproductibilité (Nextflow, pip/uv/pixi); environnement Bash/HPC/Git.
• Softskills: travail en multidisciplinaire, rigueur scientifique, esprit d’analyse et aisance à l’oral pour présenter les résultats.

Responsabilités

• Analyser des données single-cell et mettre en œuvre un pipeline d’analyse robuste (QC, normalisation, clustering, réduction de dimension).
• Évaluer des cibles et voies biologiques au sein de sous-populations cellulaires.
• Inférer des réseaux de signalisation et identifier l’activation de voies pour caractériser les profils cellulaires.
• Présenter les résultats lors de réunions techniques avec les bio-informaticiens et les biologistes.

Connaissances

Python

Single-cell analysis

R programming

Seurat

Nextflow

Bash/HPC

Git

Formation

Master 2 en bioinformatique

Dernière année d’école d’ingénieur en biologie computationnelle

Outils

scanpy

anndata

numpy

inferCNA

scDblFinder

Nextflow

bash

git

Description du poste

Servier France, au sein du Servier Paris-Saclay R&D Institute à Gif-sur-Yvette, propose un stage de Biologiste Computationnel (H/F) pour 6 mois à partir du premier trimestre 2027. Vous travaillerez dans l’équipe In Silico Target Insight sur un atlas single-cell dédié aux tumeurs cérébrales.

Vous analyserez des données single-cell avec Python et R, mettrez en place un pipeline robuste (QC, normalisation, clustering) et évaluerez des cibles et voies de signalisation.